研究者
J-GLOBAL ID:201401012490070059
更新日: 2024年03月27日
渡部 聡
ワタナベ サトシ | Watanabe Satoshi
所属機関・部署:
職名:
助教
ホームページURL (2件):
http://www2.tagen.tohoku.ac.jp/lab/inaba/html/
,
https://www.lifesci.tohoku.ac.jp/en/research/teacher/detail---id-17549.html
研究キーワード (7件):
成熟化
, ヒドロゲナーゼ
, 亜鉛
, タンパク質品質管理
, 金属タンパク質
, 結晶構造解析
, 構造生物学
競争的資金等の研究課題 (9件):
- 2023 - 2026 クライオ電子顕微鏡による「柔らかい」一回膜貫通タンパク質の可視化
- 2021 - 2026 クロススケール細胞内分子構造動態解析が解明する小胞体恒常性維持機構
- 2021 - 2024 クライオ電顕を用いたNaチャネルの構造解析による鎮痛特異的な局所麻酔薬の開発
- 2018 - 2021 免疫グロブリンMの成熟化に関与するシャペロン複合体の分子機構の解明
- 2017 - 2020 ヒドロゲナーゼ成熟化の分子機構に関する構造生物学研究
- 2015 - 2017 巨大カルシウムチャネルであるリアノジン受容体の構造と制御機構の解明
- 2014 - 2017 ヒドロゲナーゼ成熟化における金属クラスター組み込みの分子機構
- 2011 - 2015 ヒドロゲナーゼ成熟化の分子機構
- 2008 - 2011 金属タンパク質成熟化の構造生物学
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論文 (34件):
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Satoshi Watanabe, Yoshiaki Kise, Kento Yonezawa, Mariko Inoue, Nobutaka Shimizu, Osamu Nureki, Kenji Inaba. Structure of full-length ERGIC-53 in complex with MCFD2 for cargo transport. Nature Communications. 2024. 15. 1
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Han, Ba Bui, Watanabe, S, Nomura, N, Liu, K, Uemura, T, Inoue, M, Tsutsumi, A, Fujita, H, Kinoshita, K. Kato, Y, et al. Cryo-EM structures of human zinc transporter ZnT7 reveal the mechanism of Zn2+ uptake into the Golgi apparatus. Nature Communications. 2023. 14. 1. 4770-4770
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Tetsuro Matsunaga, Hirohito Sano, Katsuya Takita, Masanobu Morita, Shun Yamanaka, Tomohiro Ichikawa, Tadahisa Numakura, Tomoaki Ida, Minkyung Jung, Seiryo Ogata, et al. Supersulphides provide airway protection in viral and chronic lung diseases. Nature Communications. 2023. 14. 1
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Yuta Amagai, Momo Yamada, Toshiyuki Kowada, Tomomi Watanabe, Yuyin Du, Rong Liu, Satoshi Naramoto, Satoshi Watanabe, Junko Kyozuka, Tiziana Anelli, et al. Zinc homeostasis governed by Golgi-resident ZnT family members regulates ERp44-mediated proteostasis at the ER-Golgi interface. Nature communications. 2023. 14. 1. 2683-2683
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Zhenghao Chen, Satoshi Watanabe, Hironori Hashida, Michio Inoue, Yasukazu Daigaku, Masahide Kikkawa, Kenji Inaba. Cryo-EM structures of human SPCA1a reveal the mechanism of Ca 2+ /Mn 2+ transport into the Golgi apparatus. Science Advances. 2023. 9. 9
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MISC (19件):
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守田 匡伸, 山田 充啓, 佐々木 優作, 井田 智章, 松永 哲郎, 高田 剛, 渡部 聡, 稲葉 謙次, 石井 直人, 杉浦 久敏, et al. T細胞受容体(TCR)/CD3複合体を標的とした超硫黄分子による免疫応答制御. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2021. 94回. [P-890]
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東晃太, 松崎元紀, 渡部聡, 渡部聡, 稲葉謙次, 稲葉謙次. PDIファミリータンパク質PDIRの構造機能解析. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2021. 44th
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天貝佑太, 渡部聡, 稲葉謙次. 初期分泌経路における新たなタンパク質品質管理機構 ---亜鉛イオンとERp44の協奏. 実験医学. 2020. 38. 5. 775-782
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東晃太, 松崎元紀, 渡部聡, 稲葉謙次, 稲葉謙次. PDIファミリー酵素PDIRの3つのチオレドキシン様ドメインの異なる機能的および化学的特性. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2020. 43rd
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渡部 聡, 三木 邦夫. [NiFe]ヒドロゲナーゼ成熟化の構造生物学. 日本結晶学会誌. 2020. 62. 2. 91-98
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書籍 (4件):
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SERCA2bの構造解析
クライオ電子顕微鏡ハンドブック 2023
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Chapter 3.3 Structural Insights into Disulfide Bond Formation and Protein Quality Control in the Mammalian Endoplasmic Reticulum
Oxidative Folding of Proteins: Basic Principles, Cellular Regulation and Engineering 2018
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[2Fe-2S] Oxidative- Stress Sensor SoxR Bound to DNA
Handbook of Metalloproteins, Vol. 4 2011
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[NiFe] Hydrogenase Maturing Proteins HypC, HypD, HypE
Handbook of Metalloproteins, Vol. 4, John Wiley & Sons Ltd 2011
講演・口頭発表等 (13件):
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亜鉛依存性シャペロンERp44による基質認識・解離の分子構造基盤
(第46回日本分子生物学会年会 2023)
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ヒト由来亜鉛トランスポーターZnT7による亜鉛輸送機構の構造基盤
(第28回 INGEM & ToMMoセミナーシリーズ 2023)
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クライオ電子顕微鏡で明らかになったカーゴ受容体ERGIC-53の柔らかな全長構造
(第22回蛋白質科学会年会 2022)
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全長カーゴ受容体ERGIC-53と補助因子MCFD2との複合体のクライオ電顕構造
(第44回日本分子生物学会年会 2021)
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全長カーゴ受容体ERGIC-53と補助因子MCFD2との複合体の相関構造解析
(第59回日本生物物理学会年会 2021)
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学歴 (3件):
- 2003 - 2006 京都大学 大学院理学研究科 化学専攻 博士後期課程
- 2001 - 2003 京都大学 大学院理学研究科 化学専攻 修士課程
- 1997 - 2001 京都大学 理学部
学位 (1件):
経歴 (4件):
- 2013/06 - 現在 東北大学 多元物質科学研究所 助教
- 2007/10 - 2013/06 京都大学 大学院理学研究科 博士研究員
- 2007/04 - 2007/09 理化学研究所播磨研究所 生物超分子結晶学研究チーム 博士研究員
- 2006/04 - 2007/03 京都大学 大学院理学研究科 産学官連携研究員
受賞 (1件):
所属学会 (4件):
日本蛋白質科学会
, 日本生物物理学会
, 日本結晶学会
, 日本生化学会
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