阿久津達也

アクツタツヤ | Akutsu Tatsuya

所属機関・部署：
職名：教授
ホームページURL (1件)： http://www.bic.kyoto-u.ac.jp/takutsu/members/takutsu/japanese.html

研究分野 (3件)：知能情報学 , 情報学基礎論 , 生命、健康、医療情報学

競争的資金等の研究課題 (23件)：

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論文 (160件)：

Wataru Someya, Tatsuya Akutsu, Jean-Marc Schwartz, Jose C Nacher. Measuring criticality in control of complex biological networks. NPJ systems biology and applications. 2024. 10. 1. 9-9
Kouki Matsuda, Arata Shirakami, Ryota Nakajima, Tatsuya Akutsu, Masanori Shimono. Whole-Brain Evaluation of Cortical Microconnectomes. eNeuro. 2023. 10. 10
Jing Xu, Fuyi Li, Chen Li, Xudong Guo, Cornelia Landersdorfer, Hsin-Hui Shen, Anton Y Peleg, Jian Li, Seiya Imoto, Jianhua Yao, et al. iAMPCN: a deep-learning approach for identifying antimicrobial peptides and their functional activities. Briefings in bioinformatics. 2023. 24. 4
Koji Shiota, Akira Suma, Hiroyuki Ogawa, Takuya Yamaguchi, Akio Iida, Takahiro Hata, Mutsuyoshi Matsushita, Tatsuya Akutsu, Masaru Tateno. AQDnet: Deep Neural Network for Protein-Ligand Docking Simulation. ACS omega. 2023. 8. 26. 23925-23935
Tomoya Mori, Toshiro Takase, Kuan-Chun Lan, Junko Yamane, Cantas Alev, Azuma Kimura, Kenji Osafune, Jun K. Yamashita, Tatsuya Akutsu, Hiroaki Kitano, et al. eSPRESSO: topological clustering of single-cell transcriptomics data to reveal informative genes for spatio-temporal architectures of cells. BMC Bioinformatics. 2023. 24. 1

MISC (110件)：

阿久津達也. バイオインフォマティクス. 情報の科学と技術. 2021. 71. 6. 247-251
仲嶋なつ, 阿久津達也, 中戸隆一郎. シングルセルデータを用いた共発現遺伝子ネットワークと排他的発現遺伝子の推定手法. 細胞. 2020. 52. 13. 758-760
Tatsuya Akutsu. Analysis of Boolean Networks and Boolean Models of Metabolic Networks. Application of Omics, AI and Blockchain in Bioinformatics Research (Book Chapter). 2019
Cheng Xiaoqing, Tamura Takeyuki, Ching Wai-Ki, Akutsu Tatsuya. On the minimum number of genes required for discriminating steady states under a Boolean model. 情報処理学会第51回バイオ情報学研究会. 2017
A short review of methods for Caspase cleavage site prediction. 情報処理学会第51回バイオ情報学研究会. 2017

書籍 (7件)：

複雑ネットワークと制御理論
森北出版 2023 ISBN:9784627818811
バイオインフォマティクス : Pythonによる実践レシピ
朝倉書店 2020 ISBN:9784254122541
Algorithms for Analysis, Inference, and Control of Boolean Networks
World Scientific 2018
Sequence alignment algorithms: Applications to glycans and trees and tree-like structures
Handbook of Chemoinformatics Algorithms , , 363-381 2010
バイオインフォマティクスー配列データ解析と構造予測ー
朝倉書店 2007

講演・口頭発表等 (29件)：

ランダムフォレストとMILPを用いた化合物推定法
(2023年日本オペレーションズ・リサーチ学会秋季研究発表会 2023)
Graph Theoretic Approaches to Analysis of Biological Networks
(2023 13th International Conference on Biomedical Engineering and Technology (ICBET 2023) 2023)
On the Complexity of Tree Edit Distance with Variables
(2022)
生体ネットワークの推定と制御のための数理とアルゴリズム
(第11回生命医薬情報学連合退会 2022)
Network-based Approaches to Identification of Important Genes and Proteins
(2022 10th International Conference on Bioinformatics and Computational Biology (ICBCB 2022) 2022)

学歴 (3件)：

学位 (1件)：

経歴 (4件)：

受賞 (1件)：

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阿久津 達也