TMFunction(アーカイブ): Functional Database of Membrane Proteins

TMFunction (Archive): Functional Database of Membrane Proteins

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (1件)：タンパク質

タグ【データの種類】 (1件)：配列

生物種 (34件)： Bacillus halodurans (NCBI Taxonomy ID: 86665) , Bacteriophage M13 (NCBI Taxonomy ID: 1977402) , Bordetella pertussis (NCBI Taxonomy ID: 520) , Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) , Carassius auratus (NCBI Taxonomy ID: 7957) , Clostridium botulinum (NCBI Taxonomy ID: 1491) , Corynebacterium diphtheriae (NCBI Taxonomy ID: 1717) , Cricetulus griseus (NCBI Taxonomy ID: 10029) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Emericella nidulans (NCBI Taxonomy ID: 162425) , Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562) , Escherichia coli O157 (NCBI Taxonomy ID: 1045010) , Escherichia coli UTI89 (NCBI Taxonomy ID: 364106) , Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) , Helicobacter pylori (NCBI Taxonomy ID: 210) , Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Human herpesvirus 8 (NCBI Taxonomy ID: 37296) , Leishmania donovani (NCBI Taxonomy ID: 5661) , Manduca sexta (NCBI Taxonomy ID: 7130) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Oryctolagus cuniculus (NCBI Taxonomy ID: 9986) , Pongo pygmaeus (NCBI Taxonomy ID: 9600) , Pseudomonas aeruginosa (NCBI Taxonomy ID: 287) , Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) , Rhodobacter sphaeroides (NCBI Taxonomy ID: 1063) , Rhodopseudomonas blastica (NCBI Taxonomy ID: 1075) , Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) , Saimiri boliviensis (NCBI Taxonomy ID: 27679) , Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium (NCBI Taxonomy ID: 90371) , Shigella dysenteriae (NCBI Taxonomy ID: 622) , Staphylococcus aureus (NCBI Taxonomy ID: 1280) , Vibrio parahaemolyticus (NCBI Taxonomy ID: 670) , Xenopus (NCBI Taxonomy ID: 8353) , Xenopus laevis (NCBI Taxonomy ID: 8355)

概要：

α-ヘリックスおよびβ-バレル膜タンパク質中の機能的に重要な残基についてのデータベースです。タンパク質の基本情報やアミノ酸の修飾、変異情報の他、親和性、解離定数、IC50、活性などの実験値を格納しています。実験データは文献から収集しています。Uniprot、PDB、Pubmedなど様々な公共データベースへのリンクを持ちます。

国立研究開発法人産業技術総合研究所によるオリジナルサイト (http: //tmbeta-genome.cbrc.jp/TMFunction/) の運用は終了しました。TMFunctionのデータは引き続き生命科学系データベースアーカイブよりご利用いただけます。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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