TMBETA-GENOME (アーカイブ): Annotation of Beta-Barrel Membrane Proteins in Genomic Sequences

TMBETA-GENOMEはゲノム配列が完了している生物種のゲノム中に含まれるβ-バレル型膜タンパク質のデータベースです。各ゲノム配列に対して、機械学習と統計手法を用いた計算が実行され、それらのアノテーション結果がデータベースに格納されていました。その他、アミノ酸配列を入力してβ-バレル型膜タンパク質の判別解析を行う「TMBETA-DISC」や「TMBETA-SVM」などのツールも提供されていました。
現在、産業技術総合研究所によるオリジナルサイトからのデータ提供は終了していますが、TMBETA-GENOMEのデータベースは引き続き生命科学系データベースアーカイブからご利用いただけます。また、ツールはMEDALSのTMBETA-DISCのページ(http://medals.jp/list/detail/162.html) に情報が掲載されています。