SSBD:database: Systems Science of Biological Dynamics database

• 特定国立研究開発法人理化学研究所 生命システム研究センター

SSBDは生命動態の定量データとその取得に利用した動画像を再利用が容易なかたちで包括的に管理することを目的に構築されたデータベースです。単一分子、細胞、細胞核などのスケールにおける様々な手法により取得された様々な生物種のデータを収集しています。手法としては実験解析およびコンピュータシミュレーションともに対象としています。
定量データについては、新規に開発されたBiological Dynamics Markup Language (BDML)というデータフォーマットに従って表現されています。また動画像については、OMEROという世界標準になりつつある生命科学分野の動画像の管理システムを利用して管理されています。
本データベースに収録されているデータセットはダウンロード可能であり、各々の利用許諾にもとづいて利用することができます。
ユーザがデータを登録するSSBD:repositoryも紐づけられています。