資源
J-GLOBAL ID:201410041455616019   研究資源コード:NBDC00405 更新日:2018年03月18日

CyanoClust database: Database of homologous proteins in cyanobacteria and plastids

CyanoClust database: Database of homologous proteins in cyanobacteria and plastids
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): タンパク質
タグ【データの種類】 (2件): 配列 ,  分類
生物種 (3件): Bacteria (NCBI Taxonomy ID: 2) ,  Cyanobacteria (NCBI Taxonomy ID: 1117) ,  Paulinella chromatophora (NCBI Taxonomy ID: 39717)
概要:
原核、真核両ドメインにまたがる広汎なタンパク質についての高品質な自動クラスタリングを行うソフトウェア「GCLUST」を用いて、10種のバクテリアと38種のシアノバクテリア、59種の葉緑体、1種類の有殻アメーバの全タンパク質のクラスタリングを行い、その結果を収録したデータベースです。系統プロファイリングによる検索が可能なことが特徴です。さらに、植物プロモータデータベースPPDBとの連携により、相同タンパク質のプロモータ構造を比較することができます。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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