資源
J-GLOBAL ID:201410056200728007
研究資源コード:NBDC00090
更新日:2017年08月06日
GTOP (Rice version): Genomes to protein structures and functions
GTOP (Rice version): Genomes to protein structures and functions
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (1件):
タンパク質
タグ【データの種類】 (2件):
配列
, 3D構造
生物種 (1件):
Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530)
概要:
国立遺伝学研究所が公開している「GTOP」のイネ限定版です。GTOPはゲノムにコードされる全タンパク質の配列データを解析した結果をまとめたデータベースで、配列相同性解析を主な手段としており、立体構造予測(対PDBの配列相同性検索。Reverse PSI-BLASTを使用)、機能予測(対Swissprotの配列相同性検索。BLASTを使用)、モチーフ解析(PROSITE)、ファミリー分類(Pfam)、膜貫通ヘリックス予測(SOSUI)、コイルドコイル予測(Multicoil)、繰り返し配列解析(RepAlign)の結果が収録されています。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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