PDBj: Protein Data Bank Japan

• 大阪大学 蛋白質研究所

日本蛋白質構造データバンク (PDBj: Protein Data Bank Japan) は、米国の構造バイオインフォマティクス研究共同体 (RCSB)、生物学的磁気共鳴データバンク (BMRB)、および欧州バイオインフォマティクス研究所 (PDBe) と協力し、蛋白質・核酸・糖などの生体高分子の立体構造データベースを国際的なPDBアーカイブとして運営しています。また、派生する様々なデータベースやそれらの解析ツールも提供しています。
タンパク質の構造検索には、PDBML (eXtensible Markup Language:PDBの正式なXMLフォーマット) で記述したPDBデータに基づく関係データベースを使用しているPDBj Mine (http://pdbj.org/mine) がご利用になれます。詳細検索にはSQL文を指定した検索も可能です。
なお、PDBjのデータは日本時間の毎週水曜日午前9時に更新されています。