川島武士

カワシマタケシ | Kawashima Takeshi

所属機関・部署：
職名：助教
ホームページURL (1件)： https://kaken.nii.ac.jp/d/r/10378531.ja.html

研究分野 (3件)：進化生物学 , システムゲノム科学 , ゲノム生物学

研究キーワード (21件)：代謝経路の進化 , 半索動物 , ギボシムシ , 進化 , カタユウレイボヤ , 遺伝子発現解析 , 脊索動物門 , 被嚢動物 , 海産無脊椎動物 , 比較ゲノム , ショートリード・シーケンサー , ナメクジウオ , バイオインフォマティクス , ホヤ , 遺伝子発現情報 , 被嚢細胞 , トランスクリプトーム , 染色体地図 , 被嚢 , 遺伝的多型 , Ciona intestinalis

競争的資金等の研究課題 (7件)：

2018 - 2023 複雑ネットワークの視点からの新規細胞タイプの進化
2019 - 2022 貝殻のミューゼオミクス:博物館の収蔵標本を活かすための実験的研究
2017 - 2021 乳酸菌とビフィズス菌の基準ゲノム作成と公開
2010 - 2012 カタユウレイボヤにおける被嚢細胞の遺伝子発現解析
2005 - 2006 ホヤとナメクジウオの比較ゲノム解析

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論文 (60件)：

Tom Humphreys, Keith Weiser, Asuka Arimoto, Akane Sasaki, Gene Uenishi, Brent Fujimoto, Takeshi Kawashima, Kekoa Taparra, Janos Molnar, Noriyuki Satoh, et al. Ancestral Stem Cell Reprogramming Genes Active in Hemichordate Regeneration. Frontiers in Ecology and Evolution. 2022. 10
Shinkuro Takenaka, Takeshi Kawashima, Masanori Arita. A sugar utilization phenotype contributes to the formation of genetic exchange communities in lactic acid bacteria. FEMS microbiology letters. 2021. 368. 17
Maria Satti, Monica Modesto, Akihito Endo, Takeshi Kawashima, Paola Mattarelli, Masanori Arita. Host-Diet Effect on the Metabolism of Bifidobacterium. GENES. 2021. 12. 4
Mehwish Noureen, Takeshi Kawashima, Masanori Arita. Genetic Markers of Genome Rearrangements in Helicobacter pylori. Microorganisms. 2021. 9. 3
Rutger A Vos, Toshiaki Katayama, Hiroyuki Mishima, Shin Kawano, Shuichi Kawashima, Jin-Dong Kim, Yuki Moriya, Toshiaki Tokimatsu, Atsuko Yamaguchi, Yasunori Yamamoto, et al. BioHackathon 2015: Semantics of data for life sciences and reproducible research. F1000Research. 2020. 9. 136-136

MISC (15件)：

磯和幸延, 更科功, 紀藤圭治, 大島健志朗, 服部正平, 川島武士, 藤江学, 佐藤矩行, 遠藤一佳. 腕足動物における殻体タンパク質のプロテオーム解析. 日本古生物学会年会講演予稿集. 2016. 2016. 44
Kuni Tagawa, Asuka Arimoto, Akane Sasaki, Mizuki Izumi, Satoko Fujita, Tom Humphreys, Asao Fujiyama, Hiroshi Kagoshima, Tadasu Shin-, Yuji Kohara, et al. A cDNA Resource for Gene Expression Studies of a Hemichordate, Ptychodera flava (vol 31, pg 414, 2014). ZOOLOGICAL SCIENCE. 2014. 31. 12. 862-862
黄川田隆洋, GUSEV Oleg, 末次克行, CORNETTE Richard, 川島武士, LOGACHEVA Maria, KONDRASHOV Alexey, KONDRASHOV Alexey, PENIN Aleksey, 畑中理恵, et al. ネムリユスリカゲノムゲノム解析から見えてきた極限環境適応の進化. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2014. 37th. WEB ONLY 2P-0032
佐藤矩行, 坂本竜哉, 坂本浩隆, 遠藤一佳, 後藤太一郎, 鈴木隆仁, 古屋秀隆, 笹倉靖徳, 彦坂(片山)智恵, 川島武士, et al. 全動物門のゲノム解読にむけて 1:総論. 日本動物学会大会予稿集. 2013. 84th. 165
竹内猛, 川島武士, 小柳亮, 行者蕗, 藤江学, 宇佐美剛志, 田中牧子, 生田哲朗, 將口栄一, 藤原真幸, et al. アコヤガイ・ドラフトゲノム解読. 日本水産学会大会講演要旨集. 2011. 2011. 59

書籍 (8件)：

動物の事典
朝倉書店 2020 ISBN:9784254171662
Encyclopedia of bioinformatics and computational biology
Elsevier 2019 ISBN:9780128114148
動物学の百科事典
丸善出版 2018
Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology - 1st Edition
Elsevier 2018
次世代シーケンサー活用術: トップランナーの最新研究事例に学ぶ
化学同人 2015

講演・口頭発表等 (8件)：

オープンサイエンスの代表例DDBJの一員として動物のゲノムを比較解析
(オムニバスセミナー 2019(R1) 2019)
Research for the evolution of metabolic pathways utilizing metabolome data
(The 16th Korea-Japan-China Bioinformatics Symposium 2018 2018)
Highlight Track: Independent evolution of genomic characters during major metazoan transitions
(Highlight Track 2017)
来るべき将来における動物学と情報科学との関係を考える
(動物学と情報学の境界領域を切り開く 2017)
トランスクリプトームデータを利用した天然化合物注釈方法の開発
(日本進化学会第19回大会 2017)

学歴 (3件)：

1996 - 2001 京都大学大学院理学研究科動物学系
1992 - 1996 大阪府立大学工学部化学工学科
雲雀丘学園高等学校

学位 (1件)：

博士(理学) (京都大学理学研究科)

経歴 (12件)：

2017/03 - 現在国立遺伝学研究所生命情報研究センター助教
2016/04 - 2017/02 国立遺伝学研究所生命情報研究センター特任研究員
2015/04 - 2016/03 筑波大学生命環境系助教
2014/04 - 2015/03 学校法人沖縄科学技術大学院大学マリンゲノミックス・ユニットスタッフサイエンティストIIIグループリーダー
2013/04 - 2015/03 自然科学研究機構基礎生物学研究所生物進化研究部門特別訪問研究員

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委員歴 (5件)：

2017/04 - 現在日本バイオインフォマティクス学会理事
2014/04 - 2019/03 日本バイオインフォマティクス学会幹事
2012/04 - 2016/03 日本バイオインフォマティクス学会理事
2012/01 - 2013/12 日本進化学会庶務幹事
2011/05 - 2013/03 生命情報科学若手の会スタッフ

所属学会 (4件)：

日本地球惑星科学連合 , 日本バイオインフォマティクス学会 , 日本進化学会 , 日本動物学会

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