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J-GLOBAL ID：201602240446959401   整理番号：16A1258717

科6はMHC-DRAの第2エキソン変異の特徴とCYT B系統の進化と比較した。【JST・京大機械翻訳】

Variation characteristic of MHC-DRA exon 2 in six deer genera of family Cervidae and phylogenetic evolution compared with Cyt b

著者 (10件)： You Yuyan (Beijing Key Laboratory of Captive Wildlife Technologies,Beijing Zoo) ,  Zhang Chenglin (Beijing Key Laboratory of Captive Wildlife Technologies,Beijing Zoo) ,  Zhang Jinguo (Beijing Key Laboratory of Captive Wildlife Technologies,Beijing Zoo) ,  Ruan Xiangdong (National Forest Inventory and Design Institute) ,  Zhang Linyuan (Beijing Milu Ecological Research Center) ,  Zhong Zhenyu (Beijing Milu Ecological Research Center) ,  Zheng Changming (Beijing Key Laboratory of Captive Wildlife Technologies,Beijing Zoo) ,  Liu Xuefeng (Beijing Key Laboratory of Captive Wildlife Technologies,Beijing Zoo) ,  Wang Wei (Beijing Key Laboratory of Captive Wildlife Technologies,Beijing Zoo) ,  Cao Changlei (Yangtze Normal University)
資料名： Shengwu Xue Zazhi  (Shengwu Xue Zazhi)
巻： 33  号： 3  ページ： 34-40  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2987A  ISSN： 2095-1736  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 科6属動物の主要組織適合性複合体DRA(MHC-DRA)第二エキソンの変異特徴を検討し,その分子レベルでの進化選択パターンを明らかにし,CYT Bと比較した。配列決定法を用いて,科6属のDRAの第2エキソンの246BPの配列を得た。その結果,18の多型遺伝子座があり,13の独立した変異があった。MHC-DRA第二エキソンは低いヌクレオチド変異を示し,6属はそれぞれユニークな変異部位を有していた。アミノ酸配列における抗原結合部位は合計20であった。その中、科6属動物のアミノ酸位は63であり、ヘラジカはアミノ酸の18に属し、馬ととの異なる抗原結合部位であり、科動物は異なる抗原結合パターンを有する可能性があると推測される。非同義置換率(KA)と同義置換率(KS)比の計算結果によると、シカ属MHC-DRAの第二エクソンは正の選択であり、残りの5属はいずれも純化選択である。MHCDRAの第二エキソンとCYT Bに対してそれぞれ近隣結合法(NJ)、最尤法(ML)とベイズ推論(BI)を用いて、系統発生の再建を行い、類似の結果を得て、旧世界のシカと新世界のシカの姉妹群を形成した。Ji亜科 BとMHC-DRAの第2エキソンの遺伝子型はおそらく鹿亜科と他の亜科の間の遷移型であり、気候変化と環境の変遷はMHC-DRAの第二エクソンの分化を推進する潜在的な原因であるかもしれない。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 系統発生 ,  組織適合性 ,  アミノ酸配列 ,  アミノ酸 ,  最尤法 ,  抗原 ,  *変異 ,  遺伝子型 ,  結合部位 ,  動物
準シソーラス用語： 近隣結合法 ,  同義置換 ,  非同義置換 ,  ヘラジカ ,  ヌクレオチド変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： mhc-dra ,  molecular evolution ,  phylogenetic evolution ,  selective pressure

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： エキソン ,  変異 ,  系統 ,  進化