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J-GLOBAL ID：201602240753091552   整理番号：16A1257976

GOAL:包括的遺伝子オントロジー解析層【Powered by NICT】

GOAL: the comprehensive gene ontology analysis layer

著者 (3件)： Jeong Jong Cheol (Department of Pathology, Harvard Medical School, Beth Israel Deaconess Medical Center) ,  Li George (Bioinformatics and Computational Life Sciences Laboratory, University of Kansas) ,  Chen Xuewen (Bioinformatics and Computational Life Sciences Laboratory, University of Kansas)
資料名： Science China. Information Sciences  (Science China. Information Sciences)
巻： 59  号： 7  ページ： 070108-1-070108-8  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2579A  ISSN： 1674-733X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細胞の均一性あるいは不均一性は遺伝子と遺伝子産物の生物学的関連を解析する最も基本的かつ重要な特徴である。最近のバイオインフォマティクス技術は,次世代配列と公共プロテオーム/ゲノムデータベースのサイズ劇的に増加しから大規模データを扱うことができる自動化ハイスループット分析の適用を必要とする。遺伝子オントロジー(GO)データベースは,機械可読用語の広い被覆率に脚光を新たにされているが,GO項関係の深い考慮なしにGOを利用した応用の複雑なDBスキーマと膨大な量は,GO解析の実際の電力を希薄と紛らわしい/下で推定された結果をもたらした。一方,我々の最近の研究は,BSMスコア,機能的類似性を測定する新しい方法は明らかに既存の従来の方法より優れていることを示した。しかし,複数のデータベースを統合し,スコア行列を計算する必要とするBSMスコアを自明と生物情報学専門家にとってさえも難しくない,ウェブベースのグラフィカルユーザインタフェイス(GUI)ツール,遺伝子オントロジー解析層(目標:http://www.ittc.ku.edu/chenlab/goal)は現在美術品の画像機能的類似性計量,BSMスコアの状態によって駆動されるユーザフレンドリーなGO応用を提供するために導入された。Data from the ScienceChina, LCAS.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 被覆率 ,  類似性 ,  不均一性 ,  データ構造 ,  プロテオーム ,  GUI【計算機】 ,  *遺伝子 ,  美術 ,  データベース
準シソーラス用語： スコア ,  ハイスループット ,  大規模データ ,  バイオインフォマティクス ,  遺伝子産物 ,  *遺伝子オントロジー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 遺伝子オントロジー ,  分子機能 ,  機能的類似性 ,  ネットワークに基づく解析 ,  BSMスコア

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： GOAL ,  遺伝子オントロジー ,  解析