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J-GLOBAL ID：201602244068989485   整理番号：16A0802501

後期枯病に関連するPhytophthora infestansの新規毒性蛋白質のin silico同定【Powered by NICT】

In silico identification of novel virulent protein of phytophthora infestans related to late blight disease

著者 (4件)： Tripathi Rashmi (Dept. of Bioinformatics, Indian Institute of Information Technology-Allahabad, U.P., India) ,  Sharma Pawan (Dept. of Information Technology, Indian Institute of Information Technology-Allahabad, U.P., India) ,  Chakraborty Pavan (Dept. of Information Technology, Indian Institute of Information Technology-Allahabad, U.P., India) ,  Varadwaj Pritish (Dept. of Bioinformatics, Indian Institute of Information Technology-Allahabad, U.P., India)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2016  号： BSB  ページ： 1-5  発行年： 2016年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Phytophthora infestans(Mont.)de Bary,卵菌類モデル生物は毎年甚大な経済損失を生じるナス科ファミリー内の広い宿主範囲を持つ破壊的病原体である。Solanum tuberosum(ジャガイモ)とS.lycopersicum(トマト)の疫病を引き起こす。宿主-病原体系の現在の研究は,病原体遺伝子発現を無視したナス科メンバーの遺伝子発現パターンを強調した。本稿では病原性蛋白質の分子特性はそれらの機能的,生物物理学的及び生化学的特性に基づいて検討し,分類した。蛋白質配列の生物学的計算研究と統計解析を行った。疾患に関与する既知の病原性蛋白質の一つであるIpiO(ACU56995.1)は,HSF型DNA結合(EEY62722.1)非病原性蛋白質との類似性を示した。非病原性蛋白質の分子モデリングを行った。モデル化構造はRamachandranプロット下の本質的なパラメータを提供し,モデルの立体化学的側面はRAMPAGE Webサーバを用いて評価した。比較ゲノムアプローチ,およびP.infestans病原性蛋白質のより塩基性のレベル特性だけでなく,それらは植物における容易に理解摂動では,P.infestansの病原性と宿主特異性の理解を大いに高めるであろう。Copyright 2016 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： トマト ,  類似性 ,  病原性 ,  病原体 ,  *タンパク質 ,  疫病 ,  ナス属 ,  ナス科 ,  モデリング ,  ジャガイモ ,  *Phytophthora ,  宿主域
準シソーラス用語： 宿主特異性 ,  分子モデリング ,  *Phytophthora infestans , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： Phytophthora ,  毒性 ,  蛋白質 ,  同定