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J-GLOBAL ID：201602249135230876   整理番号：16A1237334

細菌群集の多様性配列決定に及ぼすPCR増幅の影響を分析した。【JST・京大機械翻訳】

Influence of PCR cycle number on microbial diversity analysis through next generation sequencing

著者 (7件)： An Yunhe (Beijing Center For Physical and Chemical Analysis, Beijing Engineering Technique Research Center for Gene Sequencing & Function Analysis) ,  Gao Lijuan (Beijing Center For Physical and Chemical Analysis, Beijing Engineering Technique Research Center for Gene Sequencing & Function Analysis) ,  Li Junbo (Beijing Center For Physical and Chemical Analysis, Beijing Engineering Technique Research Center for Gene Sequencing & Function Analysis) ,  Tian Yanjie (Beijing Center For Physical and Chemical Analysis, Beijing Engineering Technique Research Center for Gene Sequencing & Function Analysis) ,  Wang Jinlong (Beijing Center For Physical and Chemical Analysis, Beijing Engineering Technique Research Center for Gene Sequencing & Function Analysis) ,  Zheng Xuejuan (Beijing Center For Physical and Chemical Analysis, Beijing Engineering Technique Research Center for Gene Sequencing & Function Analysis) ,  Wu Huijuan (Beijing Center For Physical and Chemical Analysis, Beijing Engineering Technique Research Center for Gene Sequencing & Function Analysis)
資料名： Shengwu Gongcheng Xuebao  (Shengwu Gongcheng Xuebao)
巻： 32  号： 8  ページ： 1115-1123  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2184A  ISSN： 1000-3061  CODEN： SGXUED  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ハイスループット配列決定技術を用いて、複雑なサンプル中の微生物群落の組成及び変化傾向を分析することは、現在の微生物研究領域の焦点の一つとなっている。本研究では、複雑な土壌サンプルと応用範囲が広いルーメンの消化サンプルを対象とし、20、25と30三の増幅サイクル数を選び、それぞれサンプルの16S RRNA遺伝子のV3領域を増幅し、そしてライブラリー構築と配列決定を行った。最後に,細菌多様性の測定結果に及ぼす異なる増幅サイクル数の影響を,データ解析によって比較した。結果により、増幅回数が多いほど、捕獲された細菌の数量と種類が多いことが分かった。しかし,非循環数が多いほど,群落における微生物組成の比率は最良であった。全体として,増幅サイクル数が25の場合には,試料中の種の数と組成が最も優れていた。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 群落 ,  微生物 ,  *PCR法 ,  データ解析 ,  消化 ,  *細菌 ,  ミクロフローラ ,  遺伝子
準シソーラス用語： 細菌多様性 ,  土壌試料 ,  ハイスループット ,  *細菌群集 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： PCR cycle number ,  high throughput sequencing ,  microbial diversity analysis

分類 (1件)： 微生物の生態  (EG03040J)

タイトルに関連する用語 (4件)： 細菌群集 ,  多様性 ,  PCR増幅 ,  分析