蛋白質-リガンド滞留時間を推定し,予測する分子力学シミュレーションおよび動力学的測定

MOLLICA Luca; THERET Isabelle; ANTOINE Mathias; PERRON-SIERRA Francoise; CHARTON Yves; FOURQUEZ Jean-Marie; WIERZBICKI Michel; BOUTIN Jean A.; FERRY Gilles; DECHERCHI Sergio; DECHERCHI Sergio; BOTTEGONI Giovanni; BOTTEGONI Giovanni; DUCROT Pierre; CAVALLI Andrea; CAVALLI Andrea

文献

J-GLOBAL ID：201602251604039665 整理番号：16A1011475

蛋白質-リガンド滞留時間を推定し,予測する分子力学シミュレーションおよび動力学的測定

Molecular Dynamics Simulations and Kinetic Measurements to Estimate and Predict Protein-Ligand Residence Times

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著者 (16件)： , , , , , , , , , , , , , , ,
資料名：
巻： 59 号： 15 ページ： 7167-7176 発行年： 2016年08月11日
JST資料番号： D0102A ISSN： 0022-2623 CODEN： JMCMAR 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

結合および非結合の動力学は,生体中での薬剤の効果を予測する重要な因子である。結合動力学を予想するいくつかの方法が存在するが,絶対動力学を予測する効果的なコンピューター法は存在しない。文献では,主に力ずくの分子力学(MD)シミュレーションに基づく方法が報告されているが,多くの時間のコンピューターパワーを必要とする。我々は最近,ドラッグディスカバリー過程のヒットからリードおよびリード最適化で非結合動力学を予測する,新しいコンピューター法を報告している。ここでは一連のグルコキナーゼ活性化剤により,予測方法の能力を検討した。MDと実験的動力学およびX線結晶学を組み合わせ,プロトコールの信頼性を検討し,この方法が,薬剤滞留時間の推定に使用できることを示した。

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薬物の物理化学的性質 , 糖質代謝作用薬の基礎研究

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