文献

J-GLOBAL ID：201602255331793158   整理番号：16A1240316

原核微小藻類PSBA遺伝子のコドンバイアスとクラスター分析【JST・京大機械翻訳】

Cluster Analysis and Codon Usage Bias of psbA Genes From Prokaryotic Microalgae

著者 (3件)： Hou Huijing (Tianjin Key Laboratory of Food Biotechnology /College of Biotechnology and Food Science, Tianjin University of Commerce) ,  Wang Suying (Tianjin Key Laboratory of Food Biotechnology /College of Biotechnology and Food Science, Tianjin University of Commerce) ,  Wu Zijian (Tianjin Key Laboratory of Food Biotechnology /College of Biotechnology and Food Science, Tianjin University of Commerce)
資料名： Henong Xuebao  (Henong Xuebao)
巻： 30  号： 7  ページ： 1296-1307  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2036A  ISSN： 1000-8551  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： D1タンパク質は光合成反応中心の一つのタンパクであり、このタンパク質をコードするPSBA遺伝子コドンの選好性とクラスター分析は研究の分類にとって重要な意義がある。本研究では、MEGAとコドン Wソフトを用いて、PSBA遺伝子の塩基組成とコドン適応指数、有効コドン数及び相対コドン値などのパラメータを分析した。結果により、異なる属の原核微藻のPSBA遺伝子は明らかなコドンバイアスを持ち、しかもコドン使用パターンは多様性があり、この種群の種属間の近縁関係を反映することができることが明らかになった。コドンバイアスの二乗距離係数に基づくクラスタ化を行い,コドンの選好性が種の近縁関係と進化にある程度の関係があることを証明し,そのクラスタリング結果は系統発生分析の重要な補充として用いることができる。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質 ,  塩基組成 ,  光合成 ,  *コドン ,  クラスタ化 ,  *クラスタ分析 ,  嗜好性 ,  遺伝子
準シソーラス用語： 系統解析 ,  *コドンバイアス ,  微小藻類 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： microalgae ,  psbA ,  codon usage bias ,  hierarchical clustering

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 微小藻類 ,  psbA遺伝子 ,  コドンバイアス ,  クラスター分析