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J-GLOBAL ID：201602257848538070   整理番号：16A0904177

異なる末端を有する気相アミノ酸に及ぼす5代表的な力の場の性能【Powered by NICT】

Performances of Five Representative Force Fields on Gaseous Amino Acids with Different Termini

著者 (2件)： Chen Xin (University of Science and Technology of China) ,  Lin Zijing (University of Science and Technology of China)
資料名： Chinese Journal of Chemical Physics  (Chinese Journal of Chemical Physics)
巻： 29  号： 2  ページ： 179-186  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2010A  ISSN： 1674-0068  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 気相中の生体分子の構造と性質の研究に関心が高まっている。力の場の応用は気相研究の計算効率に非常に有望である。力の場の選択を支援するために,気相の中性,プロトン化,脱プロトン化とキャップされたアミノ酸の五種の代表的な力の場の性能を系統的に調べ,比較した。試験した特性は相対的立体配座エネルギー,cis及びtrans構造間のエネルギー差,予測された水素結合の数と強度,および最適化された構造の品質を含んでいる。BHandHLYP/6--311++G(d,p)の結果は,参照として用いた。GROMOS53A6とENCADSはガス状生体分子のための不十分な性能を示すことが分かった,AMBER99SB,CHARMM27とOPLSAA/Lの性能は,適用可能な場合に相当した。力場パラメータの一般的な利用可能性を考慮すれば,CHARMM27はOPLSAA/Lによる,気相における生体分子の研究のための推奨である。Data from the ScienceChina, LCAS.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 配座エネルギー ,  *アミノ酸 ,  エネルギーギャップ ,  *力の場 ,  プロトン化 ,  水素結合 ,  脱プロトン ,  *気相 ,  最適化
準シソーラス用語： 適用可能性 ,  中性 ,  計算効率 ,  生体分子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Conformation ,  相対エネルギー ,  相関係数 ,  水素結合 ,  分子力学

分類 (3件)： 分子の立体配置・配座  (BH05022J) ,  分子の電子構造  (BH05010Q) ,  アミノ酸  (CF10070V)

タイトルに関連する用語 (3件)： 気相 ,  アミノ酸 ,  力の場