2次元ゲル電気泳動分析はワタはい珠と繊維プロテオームへの概観的洞察を提供する【Powered by NICT】

Jin Xiang; Wang Limin; He Liping; Feng Weiqiang; Wang Xuchu

文献

J-GLOBAL ID：201602292102817319 整理番号：16A0881140

2次元ゲル電気泳動分析はワタはい珠と繊維プロテオームへの概観的洞察を提供する【Powered by NICT】

Two-dimensional gel electrophoresis-based analysis provides global insights into the cotton ovule and fiber proteomes

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資料名：
巻： 59 号： 2 ページ： 154-163 発行年： 2016年
JST資料番号： C2576A ISSN： 1674-7305 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：英語 (EN)

リクチメンのプロテオーム解析は二次元電気泳動(2DE)を用いた胚珠と繊維の全体的な検出可能なプロテオームをプロファイルした。全1,203独立した蛋白質スポットを代表する2DEゲル,トリプシン消化させて,マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型/飛行時間(MALDI-TOF/TOF)質量分析により同定したから収集した。質量分析やタンデム質量分析(MS,又はMS/MS)データを用いて,Gossypium hirsutumゲノム配列から構築した局所データベースに対して検索された,975の蛋白質スポット(繊維の胚珠と564の411)の同定に成功した。975の同定蛋白質の機能的アノテーション解析ははい珠特異的蛋白質は主に脂肪酸伸長,含硫アミノ酸代謝と複製後修復に関連した機能に富んでいたが,線維特異的蛋白質は根毛伸長,ガラクトース代謝とD-キシロース代謝過程に関連した機能に富んでいたことを明らかにした。さらに最も豊富な蛋白質スポットのアノテーション解析ははい珠中の全蛋白質の28.96%は主にゴルジ体,小胞体,ミトコンドリア及びリボソームに位置していたことを示したが,繊維における,全蛋白質の27.02%は,細胞骨格,核膜と細胞壁に局在していた。はい珠特異的蛋白質スポットP61,AlcamizerP93とP198の定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(qRT-PCR)解析と線維特異的蛋白質スポット230%,477%および511は,プロテオミクスデータを検証するために行った。蛋白質-蛋白質相互作用ネットワーク解析は,胚珠と繊維の間の非常に異なるネットワーククラスタパターンを明らかにした。綿胚珠と繊維における2DE検出可能な蛋白質の最大の蛋白質同定データセットを提供し,組織特異的蛋白質の潜在的に重要な役割を示し,このことから地球規模でのワタ胚珠と繊維プロテオームへの洞察を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS.【Powered by NICT】

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蛋白質・ペプチド一般 , 電気泳動分析

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