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J-GLOBAL ID：201702216767226594   整理番号：17A0078076

AMMOPIPTANTHUS AMCIP 遺伝子の遺伝子構造とイントロンの生物情報学的解析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics Analysis of Genomic Structure and Introns of AmCIP Gene from Ammopiptanthus mongolicus

著者 (5件)： Lei Chen (College of Biological Sciences and Biotechnology,National Engineering Laboratory for Tree Breeding,Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Tree and Ornamental Plants of Education Ministry,Beijing Forestry University) ,  Liu Shengli (College of Biological Sciences and Biotechnology,National Engineering Laboratory for Tree Breeding,Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Tree and Ornamental Plants of Education Ministry,Beijing Forestry University) ,  Yu Tingqiao (College of Biological Sciences and Biotechnology,National Engineering Laboratory for Tree Breeding,Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Tree and Ornamental Plants of Education Ministry,Beijing Forestry University) ,  Chen Yuzhen (College of Biological Sciences and Biotechnology,National Engineering Laboratory for Tree Breeding,Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Tree and Ornamental Plants of Education Ministry,Beijing Forestry University) ,  Lu Cunfu (College of Biological Sciences and Biotechnology,National Engineering Laboratory for Tree Breeding,Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Tree and Ornamental Plants of Education Ministry,Beijing Forestry University)
資料名： Shengwu Jishu Tongbao  (Shengwu Jishu Tongbao)
巻： 32  号： 9  ページ： 93-99  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2986A  ISSN： 1002-5464  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究の目的は,AMMOPIPTANTHUS AMCIPのゲノムDNAの構造特性と機能を分析することである。AMMOPIPTANTHUS AMCIPの遺伝子遺伝子のCDNA配列を設計し、PCRによりそのDNA配列を増幅し、生物情報学方法を用いて遺伝子の構造を分析した。配列解析により,AMMOPIPTANTHUS AMCIPのAMCIP遺伝子の長さは1BPであり,2つのエキソンと1つのイントロンを含み,GENBANK登録番号はKUであることを示した。この遺伝子のORFには、78BPのイントロン配列が存在し、同時に配列の中に嫌気性誘導に関与する増大エレメント(GC-MOTIF)と光応答エレメント(TCCC-MOTIF)が含まれている。3’-UTR領域には,光応答,ストレス応答およびホルモン応答に関与するいくつかのシス作用要素があり,5’-UTR領域にはジベレリン応答エレメント(GARE-MOTIF)のみが含まれており,これらの要素はAMCIP遺伝子の転写発現を調節する可能性がある。また,この遺伝子は高いA+T塩基含量(64.7%)を持ち,AMCIPのイントロンはGT-AG規則の保存配列を持たない,すなわちイントロン5’塩基はGT,3’塩基はTGであり,AMCIPのMRNAは独特な剪断機構を持つと推測される。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 剪断 ,  嫌気性 ,  構造特性 ,  *イントロン ,  *遺伝子 ,  保存配列 ,  シスエレメント ,  ストレス応答 ,  応答配列 ,  配列解析 ,  DNA配列 ,  ゲノムDNA ,  *バイオインフォマティクス ,  *遺伝子構造
準シソーラス用語： 光応答 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Ammopiptanthus mongolicus ,  dehydrin gene AmCIP ,  exon ,  intron ,  bioinformatics analysis

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 遺伝子 ,  遺伝子構造 ,  イントロン ,  生物情報学 ,  解析