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J-GLOBAL ID：201702217528925271   整理番号：17A0354781

低塩分ストレス下でのノリノリのトランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomic profiling of Pyropia haitanensis blade in responding to low-salinity stress

著者 (3件)： Feng Chang (College of Fisheries and Life Sciences, Shanghai Ocean University) ,  Ding Hongchang (College of Fisheries and Life Sciences, Shanghai Ocean University) ,  Yan Xinghong (College of Fisheries and Life Sciences, Shanghai Ocean University, Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources, Ministry of Education)
資料名： Shuichan Xuebao  (Shuichan Xuebao)
巻： 40  号： 12  ページ： 1842-1849  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2171A  ISSN： 1000-0615  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本稿では,低塩分ストレス下の0.5760 葉葉の生理学的メカニズムを調べるために,第二世代ハイスループット配列決定法を用いて,正常塩分(26,対照群)と低塩分(3,6,9時間)における0.5760 体葉のトランスクリプトームデータを比較した。結果により、シークエンシングデータはDE NOVOによって組み立てられ、33 872本のUNIGENESが得られ、平均長さは612 BPであることが分かった。対照群と比較して,3つの遺伝子型は,それぞれ1108,1638および1881の差次的発現遺伝子を産生した。GO機能の富化分析により、低塩分ストレスに関連する重要な生物過程は、単分子有機物の代謝過程、単糖の合成代謝と分解過程、糖質の新生、有機物の分解代謝過程などが明らかになった。KEGG代謝経路の濃縮分析により、低塩ストレスが異なる時間に蓄積した代謝経路には大きな差異があり、低塩ストレス3Hの応答の差異発現遺伝子は3つのKEGG代謝経路に濃縮され、そのうち2つはアミノ酸合成と関連し、1つは光合成と関係があることが分かった。低塩分ストレス6と9時間の差次的発現遺伝子は、糖類機能に関連する代謝経路に濃縮されることが多い。蛍光定量的PCR(QRT-PCR)の結果は,8つの差次的発現遺伝子の発現傾向がハイスループット配列決定の結果と一致することを示した。これらの結果は,0.5760の葉が低塩ストレスを受けたとき,ストレス応答が時間特異的であり,早期に主に蛋白質を合成あるいは分解することによって低塩分環境に抵抗し,ストレス時間が長くなるにつれて,細胞は可溶性物質の含有量を変化させ,エネルギー代謝を低下させることにより低塩分ストレスに抵抗することを示した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *塩分 ,  代謝経路 ,  蛍光 ,  代謝 ,  生理学 ,  定量的PCR法 ,  単糖類 ,  遺伝子型 ,  アミノ酸 ,  光合成
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  差次的遺伝子発現 ,  ハイスループット ,  *トランスクリプトーム解析 ,  *塩分ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Pyropia haitanensis ,  low-salinity stress ,  transcriptome ,  quantitative real-time PCR ,  differentially expressed genes

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (2件)： 塩分ストレス ,  トランスクリプトーム解析