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J-GLOBAL ID：201702217790002692   整理番号：17A0354267

サトウキビモザイクウイルス福州分離株物全遺伝子群集および個体群解析【JST・京大機械翻訳】

Genome cloning of two Sugarcane mosaic virus isolates from Fuzhou and phylogenetic analysis of SCMV

著者 (8件)： Deng Yuqing (Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,MOA,Fujian Agriculture and Forestry University) ,  Yang Yongqing (Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,MOA,Fujian Agriculture and Forestry University) ,  Zhai Yushan (Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,MOA,Fujian Agriculture and Forestry University) ,  Cheng Guangyuan (Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,MOA,Fujian Agriculture and Forestry University) ,  Peng Lei (Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,MOA,Fujian Agriculture and Forestry University) ,  Zheng Yanru (Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,MOA,Fujian Agriculture and Forestry University) ,  Lin Yanquan (Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,MOA,Fujian Agriculture and Forestry University) ,  Xu Jingsheng (Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding,MOA,Fujian Agriculture and Forestry University)
資料名： Zhiwu Bingli Xuebao  (Zhiwu Bingli Xuebao)
巻： 46  号： 6  ページ： 775-782  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2145A  ISSN： 0412-0914  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： サトウキビモザイクウイルス(SCYLV MOSAIC VIRUS,SCMV)の個体群情報を豊富にするために、SCMVの個体群構造を探索する。本研究では、RT-PCR法を用い、福州から採取した2つのSCMV分離物(それぞれFZ-C1とFZ-C2と命名した)のゲノムをクローニングし、すでに公表された18のSCMV分離物の全ゲノム配列と結合した。SCMV 群と群ソフトウェアを用いて,SCMVの個体群構造を分析した。結果は,FZ-C1とFZ-C2の長さがそれぞれ9NTと9NTであり,すべてBPのオープンリーディングフレームを含み,3のアミノ酸をコードすることを示した。これら2つの分離株はSCMV-A株との類似性が最も高く,酵素切断部位もSCMV-A株とほぼ一致した。系統発生分析の結果、SCMVは3つのグループに分けられ、それぞれSSG I、II、IIIと命名された。SSG Iはトウモロコシ(ZEA MAYS)に由来し、SSG IIとSSG IIIはサトウキビ(SACCHARUM SPP. HYBRID)に由来し、その中のSSG IIIは主にサトウキビに由来する。FZ分離株はSSG II群内にあった。研究結果はSCMVの全ゲノム配列情報を豊富にし、SCMV個体群の遺伝進化関係を全面的に理解するのに役立つ。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *サトウキビ ,  類似性 ,  RT-PCR法 ,  *遺伝 ,  ソフトウェア ,  ゲノム ,  *個体群 ,  アミノ酸
準シソーラス用語： 系統解析 ,  オープンリーディングフレーム ,  ゲノム配列 ,  クローニング ,  個体群構造 ,  *分離株 ,  *サトウキビモザイクウイルス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： sugarcane ,  Sugarcane mosaic virus ,  complete genome ,  phylogenetic analysis

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  酵素生理  (EG03052C) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (5件)： サトウキビモザイクウイルス ,  分離株 ,  遺伝子群 ,  個体群 ,  解析