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J-GLOBAL ID:201702218543174302   整理番号:17A0104907

長鎖非コードRNA MALAT1が調節する微小RNAを系統的に同定した。【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive Identification of MicroRNAs Regulated by Long Non-coding RNA MALAT1
著者 (5件):
資料名:
巻: 19  号:ページ: 247-251  発行年: 2016年 
JST資料番号: C3062A  ISSN: 1009-3419  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 中国語 (ZH)
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背景と目的:非コードRNA(LONG NON-CODING RNA、LNCRNA)は腫瘍の発生、浸潤転移などの過程において重要な調節作用を発揮する。本研究では,LNCRNA MALAT1によって制御される微小RNA(MICRORNA,MIRNA)を,実験とバイオインフォマティクス手段により系統的に研究した。【方法】特異1のアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)を設計し,A549細胞においてMALAT1をノックダウンした。ノック LOW DENSITY ARRAY(TLDA)チップを用いてノック1のMIRNA発現変化を研究した。遺伝子集富集解析(GENE SET ENRICHMENT ANALYSIS, GSEA)方法を用い、ノック1を発現した後の差異発現遺伝子を分析し、濃縮したMIRNAを探す。結果:ASOはMALAT1の発現を効果的に低下させ,ノック1の153個のMIRNAの発現を有意に変化させ,そのうち131個のMIRNAの発現をアップレギュレーションし,22個のMIRNAの発現を下方制御した。A549細胞においてノック1をノックダウンすると,458の遺伝子が著しく異なって発現し,GSEAの分析により複数のMIRNAが差次的に発現する遺伝子において顕著に濃縮されることを示した。TLDAとGSEAのデータを交差させ、さらに28個のMALAT1によって調節されたMIRNAを分析し、確認した。結論:本研究の系統はMALAT1のMIRNAに対する調節を同定し、更なる研究のために基礎を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】
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