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J-GLOBAL ID：201702219188653618   整理番号：17A0347816

カルスト山岳地域におけるミトコンドリアのCO I遺伝子配列解析【JST・京大機械翻訳】

Sequence Analysis of Cytochrome C Oxidase SubunitI (COI)of Mitochondrial DNA Gene of Bigeye Mandarinfish Siniperca kneri in Karst Mountain

著者 (6件)： Guo Jiankang (College of Animal Science,Guizhou University) ,  An Miao (College of Animal Science,Guizhou University) ,  Zhou Qichun (Gui Zhou Fisheries Research Institute) ,  Cao Hengyuan (College of Animal Science,Guizhou University) ,  Li Shan (College of Animal Science,Guizhou University) ,  Chen Xueweijie (College of Animal Science,Guizhou University)
資料名： Shuichan Kexue  (Shuichan Kexue)
巻： 35  号： 6  ページ： 649-657  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2602A  ISSN： 1003-1111  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 3つの地理的個体群と個体群間の遺伝的変異を理解するために,PCR法を用いて169の個体のミトコンドリアDNA I遺伝子を増幅し,配列決定し,配列長は1512BPであった。分析によると、塩基A、T、C、Gの平均含有量はそれぞれ24.9%、28.6%、28.7%、17.8%であり、そのうちA+T(53.5%)の含有量はG+C(46.5%)の含有量より高かった。169のサンプルは5つの多型遺伝子座を検出し,5つのハプロタイプを定義した。カルスト地域における 群 群のCO遺伝子Iとと I遺伝子の配列の差異を分析した結果、両者の間に10個の変異部位が存在し、1268~1456NTに集中していることが分かった。3つの個体群の間で,4つの塩基対のコドン頻度に有意差はなかったが,4つの遺伝子座の間には4つの塩基配列の差異が全くなく,コドンの第2位におけるT含有量(40.9%)は後者のものより高かった(39.9%)。しかし,AとCの含有量は後者より低かった。洞庭湖と比較して,湖,,,,およびとの4つのマンダリンと比較して,コドンの第1位および第3位には,差異があり,特に暗Guiおよび波紋Guiコドンの第3位におけるA含有量(30.0%)は,カルスト山岳地域におけるそれ(31.8%)より有意に低かった。しかし,波紋GuiG(8.9%)は,後者(7.3%)より有意に高かった。カルスト山岳地帯の の平均ハプロタイプ多様性は0.395,平均ヌクレオチド多様性は0.00029,遺伝的多様性は乏しい。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： PCR法 ,  *山岳地 ,  地理学 ,  ヌクレオチド配列 ,  *ミトコンドリア ,  塩基対 ,  個体群 ,  湖沼 ,  ハプロタイプ ,  *遺伝子 ,  コドン ,  *カルスト地形
準シソーラス用語： ミトコンドリアDNA ,  遺伝的変異 ,  *配列解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Karst Mountain ,  Siniperca kneri ,  COIgene ,  codon ,  genetic diversity

分類 (2件)： 集団遺伝学  (EC01040J) ,  昆虫・ダニによる植物被害  (FC04072U)

タイトルに関連する用語 (6件)： カルスト ,  山岳地域 ,  ミトコンドリア ,  CO ,  遺伝子配列 ,  解析