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J-GLOBAL ID：201702221516073388   整理番号：17A0107547

植物塩超敏感遺伝子(SOS1)の進化解析と選択圧力検出【JST・京大機械翻訳】

Phylogenetic Analysis and Detection of Selective Pressure on Plant Salt Overly Sensitive Genes

著者 (6件)： Yang Ping (Nanjing Xiaozhuang University) ,  Zhou Feng (Nanjing Xiaozhuang University) ,  Zhang Bianjiang (Nanjing Xiaozhuang University) ,  Wang Like (Nanjing Xiaozhuang University) ,  Qian Baoli (Nanjing Xiaozhuang University) ,  Chen Quanzhan (Nanjing Xiaozhuang University)
資料名： Fenzi Zhiwu Yuzhong  (Fenzi Zhiwu Yuzhong)
巻： 14  号： 8  ページ： 2098-2105  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2681A  ISSN： 1672-416X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 植物塩超敏感遺伝子(SALT OVERLY SENSITIVE 1、SOS1)を研究対象とし、SOS1遺伝子の進化過程における選択圧力を検討することにより、植物のストレス成長適応性の研究に根拠を提供する。生物情報学的分析法により、NCBIなどのウェブサイトから完全な植物SOS1遺伝子コード領域の核酸配列とタンパク質のアミノ酸配列を獲得し、MEGAとMRBAYESソフトウェアを利用して進化進化を構築した。PAMLらのソフトウェアを用いて,61個のSOS1遺伝子配列の生物選択圧を分析し,相関係数を計算した。系統樹は,SOS1遺伝子が3つの枝に分割され,SOS1の単子葉植物の分枝,SOS1の双子葉植物群の分岐,SOS1の植物の分枝であることを明らかにした。PAMLソフトウェアを用いて、植物SOS1遺伝子配列の遺伝子座に対して正の選択点分析を行った。(1)M8モデルは39個の正の選択部位を検出し、22個の遺伝子座は顕著なレベルに達し、そのうち17個は極めて著しいレベルに達した。(2)浄化選択はSOS1遺伝子に対して主導的役割を果たす。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アミノ酸配列 ,  相関係数 ,  ソフトウェア ,  適応性 ,  系統樹 ,  ヌクレオチド配列 ,  単子葉植物 ,  *遺伝子 ,  双子葉植物
準シソーラス用語： *選択圧 ,  遺伝子配列 ,  Webサイト ,  NCBI ,  バイオインフォマティクス ,  進化過程 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： SOS1 gene ,  Selection pressure ,  Adaptive evolution ,  Purifying selection

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： 植物 ,  塩 ,  遺伝子 ,  進化 ,  解析 ,  圧力検出