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J-GLOBAL ID：201702221574344842   整理番号：17A0196507

2016年に中国の一部の地域における類30の新繁殖と呼吸症候群ウイルスの遺伝的変異の分析【JST・京大機械翻訳】

Genetic variations of a new subgroup of NADC30-Like porcine reproductive and respiratory syndrome virus from China in 2016

著者 (15件)： Zhang Hongliang (Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhang Jing (Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Li Zhen (Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhang Wenli (Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Liu Chunxiao (Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Chen Jiazeng (Shandong Sinder Technology Co., LTD) ,  Xiang Lirun (Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Leng Chaoliang (Nanyang Normal University) ,  Peng Jinmei (Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Wang Qian (Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Bai Yun (Shandong Sinder Technology Co., LTD) ,  An Tongqing (Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Tong Guangzhi (Shanghai Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Cai Xuehui (Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Tian Zhijun (Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Zhongguo Yufang Shouyixuebao  (Zhongguo Yufang Shouyixuebao)
巻： 38  号： 9  ページ： 675-680  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3099A  ISSN： 1008-0589  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究では,類30の繁殖と呼吸症候群ウイルス(PRRSV)の中国における新しい流行特性を理解するために,GENBANKにおける2012年に提出されたPRRSV NADC30株の全ゲノム配列に基づいて8対のプライマーを設計した。RT-PCRの方法により,本研究室では2016年に4つの省から収集した臨床試料から検出した15株のNADC30 PRRSVS株について全ゲノム配列決定を行い,株と結合して配列解析を行った。NSP2のアミノ酸配列を比較することにより,15のPRRSVSがAA323AA433+AA484+AA505AA523(111+1+19)の131アミノ酸欠失の分子特性を持つことを示した。RDP4と分析の生物学的ソフトウェアによる分析により、15株のPRRSVS株のうち14株は組換え型ウイルス株であり、組み換え型の親本病株はPRRSV NADC30株であることが分かった。組換え遺伝子フラグメントを提供するウイルス株はHP-PRRSVあるいはVR2332を代表とする古典的なPRRSV株であり、これらの類30組換え型の組換え位置、組換えの遺伝子断片及び組換え断片の長さはいずれも多様性がある。また、組み換えの位置は非構造タンパク質あるいは二次構造タンパク質をコードする遺伝子領域に位置することが多い。全ゲノムワイド分析によると、これらのウイルス株は国内以前に流行しているHP-PRRSVに属し、相同性はわずか83.4%~87.2%であり、その他の類30株とは比較的に独立した分枝に位置している。以上の結果により、これらのウイルス株はすでに一つの新しい亜群を形成し、5亜群と命名した。本研究では,異なる地域におけるPRRSVのヌクレオチド相同性は大きく異なり,88.6%~99.6%であり,2つのウイルス株のみがPAMとMARC-145細胞に感染した。本研究により、遺伝子欠損と遺伝子組換えの多様性を主な特徴とする5亜群PRRSVはすでに中国で流行しており、その生物学的特性について更なる研究が必要である。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相同性 ,  アミノ酸配列 ,  遺伝子 ,  *ウイルス ,  タンパク質 ,  RT-PCR法 ,  中華人民共和国 ,  遺伝子欠損
準シソーラス用語： 遺伝子組換 ,  組換体 ,  分子特性解析 ,  配列解析 ,  ゲノム配列 ,  ブタ繁殖呼吸障害症候群ウイルス ,  *遺伝的変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： porcine reproductive and respiratory syndrome virus ,  NADC30-Like ,  deletion ,  recombination ,  subgroup5

分類 (4件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝的変異  (EC01030Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

タイトルに関連する用語 (9件)： 中国 ,  地域 ,  類 ,  繁殖 ,  呼吸 ,  症候群 ,  ウイルス ,  遺伝的変異 ,  分析