DNAメチルトランスフェラーゼの配列と遺伝子発現解析【JST・京大機械翻訳】

Dai Mengyuan; Gao Mei; Guo Lifen; Deng Jianchuan; Li Wenchang

文献

J-GLOBAL ID：201702222267088727 整理番号：17A0097038

DNAメチルトランスフェラーゼの配列と遺伝子発現解析【JST・京大機械翻訳】

Sequence and Gene Expression Analysis of DNA Methyltransferase in Castor Bean (Ricinus communis L.)

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巻： 31 号： 4 ページ： 604-614 発行年： 2016年
JST資料番号： C2745A ISSN： 1004-390X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

植物のDNAメチル化は遺伝子発現を制御し、遺伝子を保護し、ストレス耐性などの関連するエピジェネティックな現象であり、その中の鍵酵素であるDNAメチルトランスフェラーゼはDNA配列のメチル化とメチル化を維持する。本研究では、ヒマ全ゲノムに基づき、生物情報学的分析方法、トランスクリプトームデータとRT-PCR半定量分析を結合し、リシンDNAメチルトランスフェラーゼのアミノ酸配列の構造特徴、系統発生と発現形式を同定した。結果は以下の通り。8つのDNAメチルトランスフェラーゼ遺伝子を,相同性配列BLASTによってヒマゲノムデータベースから得た。系統発生分析は,8つの蛋白質を4つの亜群に分割した。2つのMET相同蛋白質、2つのCMTホモログ、3つのDRMホモログと1つのDNMT2相同タンパク質は、さらにDNAメチルトランスフェラーゼが系統進化において比較的に保存され、分化が単子葉植物の分化後に発生することを発見した。8つのDNAメチルトランスフェラーゼは核内に位置していることが,細胞内局在分析により確認された。蛋白質ドメインの比較により、8つのタンパク質のC末端触媒ドメインには、6つの保存モチーフがメチル化修飾触媒機能に関与していることが示され、タンパク質は基本的な触媒メチル化機能を持ち、N末端調節機能ドメインの差異はタンパク質を四種類に分けることができる。そのうち、RCDNMT2はN末端調節領域が欠けている。トランスクリプトームデータとRT-PCR半定量分析により、ヒマDNAメチルトランスフェラーゼ(遺伝子2以外)は発育胚乳において他の検出組織より高い発現を示し、この時期の胚乳低メチル化はメチル化遺伝子の高発現を誘導することが推測された。これらの結果は,ヒマのDNAメチルトランスフェラーゼの特性を理解するための重要な理論的指針を提供する。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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