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J-GLOBAL ID：201702222562851495   整理番号：17A0618395

Y染色体:Y染色体のモザイク欠失に関連する遺伝的バリアントは発がんリスクと重なっており,細胞周期遺伝子の重要性が明らかになる

Genetic variants associated with mosaic Y chromosome loss highlight cell cycle genes and overlap with cancer susceptibility

著者 (21件)： WRIGHT Daniel J (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  DAY Felix R (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  KERRISON Nicola D (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  CARDONA Alexia (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  LANGENBERG Claudia (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  WAREHAM Nicholas J (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  SCOTT Robert A (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  ONG Ken K (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  PERRY John R B (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  ZINK Florian (deCODE Genetics-Amgen, Inc., Reykjavik, ISL) ,  SULEM Patrick (deCODE Genetics-Amgen, Inc., Reykjavik, ISL) ,  SIGURJONSDOTTIR Svanhvit (deCODE Genetics-Amgen, Inc., Reykjavik, ISL) ,  GUDBJARTSSON Daniel F (deCODE Genetics-Amgen, Inc., Reykjavik, ISL) ,  HELGASON Agnar (deCODE Genetics-Amgen, Inc., Reykjavik, ISL) ,  THORSTEINDOTTIR Unnur (deCODE Genetics-Amgen, Inc., Reykjavik, ISL) ,  STEFANSSON Kari (deCODE Genetics-Amgen, Inc., Reykjavik, ISL) ,  THOMPSON Deborah J (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  CHAPMAN J Ross (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  JACKSON Steve P (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  THORSTEINDOTTIR Unnur (Univ. Iceland, Reykjavik, ISL) ,  STEFANSSON Kari (Univ. Iceland, Reykjavik, ISL)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 49  号： 5  ページ： 674-679  発行年： 2017年05月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Y染色体は造血細胞で欠失していることが多く,この欠失が男性における最も頻度の高い体細胞性のゲノム変化である。しかし,Y染色体のモザイク欠失(mLOY)を調節している機序,そしてその臨床的関連性は明らかでない。このたび,85,542人の男性の遺伝子型アレイ強度データや配列リードを用いて,mLOYに関連を示す19のゲノム領域を同定した(P<5×10^-8)。次に,これらの座位を用いて,女性でのX染色体欠失を予測した(n=96,123,P=4×10^-6)。さらに全血試料のエピゲノム規模メチル化解析を行い,mLOYと関連して特異的にメチル化されている36の部位を明らかにした。同定された遺伝子は,細胞増殖や細胞周期の調節に関係する遺伝子に集中しており,DNA合成(NPAT),DNA損傷応答(ATM),有糸分裂(PMF1,CENPN,MAD1L1),アポトーシス(TP53)などがある。mLOYと発がんリスクとの間の共通した遺伝的構造が示されると同時に,mLOYが喫煙によって引き起こされると推論する。まとめると今回の研究結果は,遺伝子型アレイ強度データから,集団の規模で細胞周期の効率を定量的に計測することが可能になり,異数性,ゲノム不安定性,発がんリスクに関与する遺伝子を同定できることを明らかにした。Copyright Nature Japan KK 2017

シソーラス用語： 男性 ,  *Y染色体 ,  LOH【遺伝】 ,  *染色体異常 ,  遺伝子型 ,  ゲノム ,  メチル化 ,  *遺伝子 ,  変異 ,  リスク ,  喫煙 ,  細胞周期 ,  不安定性 ,  分子遺伝現象 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： *Y染色体モザイク欠失 ,  エピゲノム ,  ゲノム不安定性 ,  *ヒトY染色体 ,  異数性 ,  遺伝的構造 ,  遺伝的変異 ,  *細胞周期関連遺伝子 ,  染色体欠失 ,  発癌リスク

分類 (4件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  細胞構成体一般  (EF03010Z) ,  細胞分裂・増殖  (EF02020D) ,  発癌機序・因子  (GE02020C)

タイトルに関連する用語 (8件)： Y染色体 ,  モザイク ,  欠失 ,  遺伝的バリアント ,  発がんリスク ,  細胞周期 ,  遺伝子 ,  重要性