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J-GLOBAL ID：201702223080757982   整理番号：17A0161803

ユビキチン結合酵素遺伝子ファミリーの生物情報学的予備分析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics Preliminary Analysis of Ubiquitin Conjugating Enzyme Gene Family in Cacao

著者 (5件)： Zhao Qiufang (Institute of South Subtropical Corp Research, Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Key Laboratory of Tropical Fruit Biology, Ministry of Agriculture) ,  Dong Chen (Institute of South Subtropical Corp Research, Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Key Laboratory of Tropical Fruit Biology, Ministry of Agriculture) ,  Jue Dengwei (Institute of South Subtropical Corp Research, Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Key Laboratory of Tropical Fruit Biology, Ministry of Agriculture) ,  Chen Hongliang (Institute of South Subtropical Corp Research, Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Key Laboratory of Tropical Fruit Biology, Ministry of Agriculture) ,  Jia Liqiang (Institute of South Subtropical Corp Research, Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Key Laboratory of Tropical Fruit Biology, Ministry of Agriculture)
資料名： Redai Zuowu Xuebao  (Redai Zuowu Xuebao)
巻： 37  号： 9  ページ： 1732-1740  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2969A  ISSN： 1000-2561  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ユビキチン結合酵素(E2S)は基質ユビキチン化あるいはE3Sリンクを促進し,標的蛋白質ユビキチン化の鍵酵素であり,ユビキチン-プロテアソーム経路において重要な役割を果たす。こと(CACAO CACAO L.)の全ゲノム配列データを用いて、45個のE2S遺伝子ファミリーメンバーを同定し、39個のUBCと6個のUEV遺伝子を含む。E2Sファミリーの基本的な物理化学的性質,遺伝子構造,二次構造予測,亜細胞局在化,進化関係などを,バイオインフォマティクス法により予備的に分析した。結果は以下を示す。E2S遺伝子CDSの長さは441(TCUEV3)~3BP(TCUBC7)の間にあり、対応するコードタンパクのアミノ酸の数は146(TCUEV3)~1216AA(TCUBC7)の間であった。コード化蛋白質の分子量は16.39~134.71KUであった。E2S遺伝子のエキソンは1~11の間にあり、多くの遺伝子のエキソン数は5~7の間である。E2S遺伝子は10個の染色体に分布し、1番染色体は7個で、数量が最も多かった。6番染色体の2つの遺伝子は,最も少なかった。E2S蛋白質の大部分は不安定な蛋白質であり,親水性蛋白質であり,その二次構造はΑ-ヘリックスとランダムコイルを主成分とする。多くのE2Sタンパク質は細胞核に定位し、小胞体あるいは細胞質に局在する。進化ツリー解析は以下のことを示した。E2Sタンパク質は20個の亜族に分けられ、16個のUBC亜族と4個のUEV亜族を含み、第VI亜族E2Sの数は最も多いのは9個である。E2Sファミリータンパクは種の進化過程において高度に保存性がある。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： プロテアソーム ,  染色体 ,  小胞体 ,  タンパク質 ,  *遺伝子 ,  基質 ,  二次構造 ,  *ユビキチン ,  分子量 ,  ユビキチン化 ,  アミノ酸
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  *バイオインフォマティクス ,  *遺伝子ファミリー ,  *ユビキチン結合酵素 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Cacao(Theobroma cacao L) ,  Ubiquitin conjugating enzyme(E2s) ,  Gene family ,  Bioinformatics

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (4件)： ユビキチン結合酵素 ,  遺伝子ファミリー ,  生物情報学 ,  分析