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J-GLOBAL ID：201702226421630558   整理番号：17A0074495

ヒメトビウンカが保有するイネ縞ウイルスNS2とNS3遺伝子の分子変異【JST・京大機械翻訳】

Molecular Variality of NS2 and NS3 Genes from Rice Stripe Virus in Laodelphax striatellus

著者 (5件)： Ren Chunmei (Institute of Plant Protection, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences) ,  Cheng Zhaobang (Institute of Plant Protection, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences) ,  Yang Liu (Institute of Plant Protection, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences) ,  Miao Qian (Institute of Plant Protection, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhou Yijun (Institute of Plant Protection, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Xinan Nongye Xuebao  (Xinan Nongye Xuebao)
巻： 29  号： 8  ページ： 1854-1863  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3020A  ISSN： 1001-4829  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ヒメトビウンカ(携帯 携帯 VIRUS,RSV)のNS2と遺伝子の分子変異の特徴を明らかにするために、レーザクラッディングの産卵方法は江蘇省、雲南省、山東省、河北省などから20個のヒメトビウンカが保有するRSV分離物を獲得した。RT-PCRによりNS2とNS3遺伝子の特異的断片を増幅し、増幅産物に対してクローン配列決定を行い、さらにGENBANKで報告された他の分離物配列と結合し、生物情報学ソフトウェアを用いて不同寄主、地域分離物の分子変異特徴及び系統発生関係を分析した。配列分析により,20分離株のNS2とNS3遺伝子のヌクレオチド配列の相同性はそれぞれ96.5%~100%(NS2)と95.4%~100%であることを示した。推定蛋白質のアミノ酸配列の相同性は97.0%~100%(NS2)と96.2%~100%(NS3)であった。ヌクレオチド配列に基づく系統樹分析により、2つの遺伝子はいずれも明らかに2つのグループに分けられ、その一つはいずれも中国雲南省の水稲のにであり、2つのグループ間の遺伝距離はそれぞれ0.05711(NS2)と0.06081(NS3)であることが分かった。2遺伝子のZ-TESTの検出結果はいずれも強い負の選択圧にあることを示した。2遺伝子アミノ酸から構築した系統樹と変異ホットスポットの分析によると、そのアミノ酸配列の分子変異はまず地政学と関連し、2遺伝子はいずれも中国雲南と雲南以外の2つの地理亜群に分けることができる。次に宿主と関連し,ヒメトビウンカとイネの2つの遺伝子に分けることができる。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 系統樹 ,  系統発生 ,  *遺伝子 ,  相同性 ,  クローン ,  水稲 ,  RT-PCR法 ,  アミノ酸配列 ,  ヌクレオチド配列 ,  *ヒメトビウンカ
準シソーラス用語： 遺伝距離 ,  バイオインフォマティクス ,  アンプリコン ,  *NS3蛋白質 ,  *NS2蛋白質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Rice stripe virus ,  NS2 and NS3 genes ,  Molecular valiality ,  Hosts colony ,  Geographical colony

分類 (2件)： 肉盛  (WC07060N) ,  クラッド材  (WE04020G)

タイトルに関連する用語 (10件)： ヒメトビウンカ ,  保有 ,  イネ ,  縞 ,  ウイルス ,  NS2 ,  NS3 ,  遺伝子 ,  分子 ,  変異