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J-GLOBAL ID：201702229363256642   整理番号：17A0087333

比較ゲノミクスアプローチによる二倍体ワタ,Gossypium raimondiiの完全ミトコンドリアゲノム配列の解析

Analysis of the Complete Mitochondrial Genome Sequence of the Diploid Cotton Gossypium raimondii by Comparative Genomics Approaches

著者 (9件)： BI Changwei (Nanjing Forestry Univ., Jiangsu, CHN) ,  PATERSON Andrew H. (Univ. Georgia, GA, USA) ,  WANG Xuelin (Nanjing Forestry Univ., Jiangsu, CHN) ,  XU Yiqing (Nanjing Forestry Univ., Jiangsu, CHN) ,  WU Dongyang (Nanjing Forestry Univ., Jiangsu, CHN) ,  QU Yanshu (Nanjing Forestry Univ., Jiangsu, CHN) ,  JIANG Anna (Nanjing Forestry Univ., Jiangsu, CHN) ,  YE Qiaolin (Nanjing Forestry Univ., Jiangsu, CHN) ,  YE Ning (Nanjing Forestry Univ., Jiangsu, CHN)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2016  号： Genomics  ページ： ROMBUNNO.5040598 (WEB ONLY)  発行年： 2016年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ワタは最重要の経済的作物の1種で,天然繊維の主要供給源とともに飼料にとって重要蛋白質源である。G.raimondiiの完全核および葉緑体(cp)ゲノム配列は既に利用可能であるが,ミトコンドリアは利用できない。本研究では,G.raimondiiの完全ミトコンドリア(mt)DNA配列を676,078bp長の環状ゲノムに組込み,他の高等植物と比較解析した。本ゲノムは39種の蛋白質コード遺伝子,6種のrRNA遺伝子,25種のtRNA遺伝子を含む。本研究ではまた本mtゲノムに4つのより長鎖反復配列(63.9kb,10.6kb,9.1kb,2.5kb)を同定した。これは,ワタ進化における分子内組換に活用された可能性がある。驚くべきことに,G.raimondii mtゲノムのほぼすべてがChr1の核に転位しており,転位現象は非常に最近のものと思われる。系統発生分析により,アオイ科メンバーとしてのG.raimondiiは他のバラ類よりも別のワタ属(G.barbadense)に非常に近縁で,2つのGossypium種によって形成されたクレードはアブラナ科の姉妹であることが明らかになった。G.raimondii mtゲノムはワタおよび他の高等植物における進化分析,分子生物学,および細胞質雄性不稔に関する重要知見を提供する。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *ワタ ,  *ミトコンドリア遺伝子 ,  種差 ,  配列相同性 ,  反復配列 ,  *種分化 ,  二倍体 ,  アブラナ科 ,  遺伝資源 ,  作物育種 ,  転位【遺伝】 ,  RNAエディティング ,  遺伝学実験技術
準シソーラス用語： 比較ゲノミクス

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  繊維料作物  (FC03077U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 比較ゲノミクス ,  二倍体 ,  ワタ ,  Gossypium ,  ミトコンドリア ,  ゲノム配列 ,  解析