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J-GLOBAL ID：201702233012118002   整理番号：17A0201668

オオムギASYMMETRIC LEAVES2/LATERAL ORGAN BOUNDARIES(AS2/LOB)遺伝子ファミリーの全ゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

A genome-wide analysis of the ASYMMETRIC LEAVES2/LATERAL ORGAN BOUNDARIES (AS2/LOB) gene family in barley (Hordeum vulgare L.)

著者 (9件)： Guo Baojian (Barley Research Institution of Yangzhou University, Yangzhou University) ,  Wang Jun (Lianyungang Agricultural Science) ,  Lin Shen (Barley Research Institution of Yangzhou University, Yangzhou University) ,  Tian Zheng (Barley Research Institution of Yangzhou University, Yangzhou University) ,  Zhou Kai (Barley Research Institution of Yangzhou University, Yangzhou University) ,  Luan Haiye (Barley Research Institution of Yangzhou University, Yangzhou University) ,  Lyu Chao (Barley Research Institution of Yangzhou University, Yangzhou University) ,  Zhang Xinzhong (Barley Research Institution of Yangzhou University, Yangzhou University) ,  Xu Rugen (Barley Research Institution of Yangzhou University, Yangzhou University)
資料名： Journal of Zhejiang University - Science B. Biomedicine & Biotechnology  (Journal of Zhejiang University - Science B. Biomedicine & Biotechnology)
巻： 17  号： 10  ページ： 763-774  発行年： 2016年 
JST資料番号： W1572A  ISSN： 1673-1581  CODEN： JZUSAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 目的;オオムギ全ゲノムからAS2/LOB遺伝子ファミリーを同定し、遺伝子進化、遺伝子構造、染色体定位及び組織、発現分析を行い、オオムギASL/LBD遺伝子の更なる機能研究と鑑定に基礎を築いた。革新点:オオムギの全ゲノムレベルでAS2/LOB遺伝子ファミリーを分析し、一部の遺伝子の機能に対して予測と分析を行った。方法;オオムギのAS2/LOB遺伝子ファミリーのメンバーを,オオムギのゲノムデータベースを用いてバイオインフォマティクスにより同定した。MEGA6ソフトウェアを用いて系統樹解析を行った。GSDSととツールを用いて遺伝子構造と染色体定位分析を行った。既存のオオムギRNASEQデータを用いて組織発現プロファイリングを行った。結論;全ゲノム解析によると、オオムギAS2/LOBファミリー遺伝子は24のメンバーを含み、進化上に二つのタイプに分けられ、7つの亜族に分布し、オオムギの7つの染色体に分布し、組織の発現パターンは多様性があり、すでに報告されたASL/LBD遺伝子と良好な相同性がある。これらの情報はオオムギAS2/LOB遺伝子ファミリーの機能分析に基礎を築いた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 機能分析 ,  *ゲノム ,  *オオムギ ,  分子進化 ,  *遺伝子 ,  相同性 ,  染色体
準シソーラス用語： 遺伝子発現パターン ,  プロファイリング ,  系統解析 ,  バイオインフォマティクス ,  ゲノムデータベース ,  遺伝子構造 ,  *全ゲノム解析 ,  *遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Barley ,  AS2/LOB gene family ,  Phylogenetic tree ,  Expression pattern

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： オオムギ ,  遺伝子ファミリー ,  全ゲノム解析