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J-GLOBAL ID:201702233377622714   整理番号:17A0398569

特異的混合は重要な調節不全とりん酸化部位の比較定量化を促進する【Powered by NICT】

Specific mixing facilitates the comparative quantification of phosphorylation sites with significant dysregulations
著者 (15件):
資料名:
巻: 950  ページ: 129-137  発行年: 2017年 
JST資料番号: A0394A  ISSN: 0003-2670  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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質量分析(MS)プロテオームとプロテオームの翻訳後修飾(PTM)の定量的分析に基づく生物学的,薬剤および臨床研究においてますます重要な役割を果たしている。しかし,比較蛋白質試料中の極端な相対存在量を持つ蛋白質または蛋白質PTM部位,有意に調節不全などを正確に定量するための大きな課題である。ここでは,同位体標識前に特異的な比(MaSR)で混合,新規定量戦略は,極端な蛋白質と蛋白質りん酸化部位の定量精度と被覆率を改善するために開発した。比較蛋白質試料を最初に9:1と1:9(w/w)の特異的比,質量分化軽及び重同位体標識後で一緒に混合した。,新しく発現したまたは消失したものも,極端な蛋白質と蛋白質りん酸化部位は蛋白質の相対的豊度の全てがこの戦略により2桁(1/9 9)に調整したにより正確に定量することができた。20倍以上の変化で定量化されたりん酸化部位の数はHeLa細胞の過バナジン酸誘導リン酸化プロテオームの比較定量で約10倍改善され,134は新しく生成された21消失りん酸化部位は単にMaSR戦略により定量した。有意にアップレギュレートされりん酸化部位は主にインスリン関連経路を調節する重要なりん蛋白質に関与していた,PI3K-AKTとRAS-MAPK経路である。MaSR戦略は有意な調節異常を用いた生物学的過程を解明する上で有望な方法として示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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分類 (1件):
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蛋白質・ペプチド一般 
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