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J-GLOBAL ID：201702234591645963   整理番号：17A0394633

CDNA-組み合わせ差異に基づくサトウキビ応答水分ストレス遺伝子発現プロファイリングを解析した。【JST・京大機械翻訳】

Gene expression analysis of sugarcane response to water stress based on cDNA-SCoT differential display

著者 (10件)： Wu Kaichao (Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences) ,  Huang Chengmei (Guangxi Crop Genetic Improvement and Biotechnology Laboratory) ,  Deng Zhinian (Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences) ,  Wei Yuanwen (Guangxi Crop Genetic Improvement and Biotechnology Laboratory) ,  Cao Huiqing (Guangxi Crop Genetic Improvement and Biotechnology Laboratory) ,  Xu Lin (Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences) ,  Jiang Shengli (Guangxi Crop Genetic Improvement and Biotechnology Laboratory) ,  Wu Jianming (Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences) ,  Yang Litao (Guangxi University) ,  Li Yangrui (Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Nanfang Nongye Xuebao  (Nanfang Nongye Xuebao)
巻： 47  号： 12  ページ： 1999-2008  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2960A  ISSN： 2095-1191  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【目的】本研究の目的は,サトウキビの水分ストレスの差次的遺伝子発現を研究し,サトウキビの水分ストレスの分子機構をさらに研究し,サトウキビの干ばつ耐性の総合的遺伝的改良の研究のための科学的基礎を提供することであった。[方法]GT11を材料とし、それぞれ対照、干ばつ、再潅水の3つの処理のトータルRNAプールを構築し、CDNA-組み合わせの差異を用いて、GT11の長期応答水分ストレスの遺伝子発現プロファイルを構築し、TDFSを選別し、配列決定した。NCBIデータベースでBLAST相同性検索を行い,相同遺伝子により遺伝子機能を推定した。[結果]42の組み合わせプライマーを用いて,180のTDFSをスクリーニングし,100のTDFSがNCBIデータベースに登録された遺伝子と高い類似性を持ち,相同遺伝子機能により14のタイプに分類されることを示した。代謝関連遺伝子(11個),エネルギー代謝関連遺伝子(12個),輸送経路関連遺伝子(5個),通信及びシグナル伝達関連遺伝子(3個),転写調節因子関連遺伝子(3個),蛋白質プロセシング関連遺伝子(1個),機能関連蛋白質(7個),環境関連遺伝子(4個),未知の関連遺伝子(1個),防御関連遺伝子(4個),未知機能遺伝子(22個)。[結論]サトウキビの水分ストレスの調節経路は多様性、複雑性、協調性と網羅性がある。CDNA-組み合わせの差異は,水分ストレス関連のTDFSをスクリーニングし,サトウキビの水分調節経路の分子機構の更なる研究のための重要な情報を提供することができることを示した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *水分ストレス ,  耐干性 ,  *遺伝子 ,  類似性 ,  データベース ,  *水分 ,  干ばつ ,  *サトウキビ
準シソーラス用語： 遺伝子機能 ,  相同遺伝子 ,  BLAST ,  NCBI ,  分子機構 ,  差次的遺伝子発現 ,  *遺伝子発現プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： sugarcane ,  cDNA-SCoT ,  water stress ,  rewatering ,  gene expressing profile

分類 (3件)： 野菜  (FC03043X) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物に対する影響  (EE04030Z)

タイトルに関連する用語 (7件)： 組み合わせ ,  差異 ,  サトウキビ ,  応答 ,  水分ストレス ,  遺伝子発現プロファイリング ,  解析