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J-GLOBAL ID：201702238603751490   整理番号：17A0174656

PAENIBACILLUS SHENYANGENSISのDNA配列の組み込みと組立【JST・京大機械翻訳】

DNA Sequence Assembly of Paenibacillus Shenyangensis

著者 (3件)： Fu Lili (School of Resources & Civil Engineering, Northeastern University) ,  Jiang Binhui (School of Resources & Civil Engineering, Northeastern University) ,  Hu Xiaomin (School of Resources & Civil Engineering, Northeastern University)
資料名： Dongbei Daxue Xuebao(Zirankexueban)  (Dongbei Daxue Xuebao(Zirankexueban))
巻： 37  号： 10  ページ： 1465-1468  発行年： 2016年 
JST資料番号： C5017A  ISSN： 1005-3026  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 既存の配列データに基づき,3つの一般的配列ソフトウェアを用いて,PAENIBACILLUS 全の全ゲノム配列を分析し,最適パラメータにおける異なるソフトウェアのDNA配列を比較した。また,NCBIデータベースにおける他の近縁種との比較により,遺伝子の予測と予測を行った。結果は,SOAPDENOVOの組立結果が最適化され,K-MERが23のとき,ゲノムの全長とN50はそれぞれ5と467BPであることを示した。予測された4つの800の遺伝子のうち、4つの393個はNCBI-NRデータベースと比較し、アノテーションが成功した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *データベース ,  最適化 ,  ソフトウェア ,  ゲノム ,  アノテーション ,  遺伝子
準シソーラス用語： 近縁種 ,  NCBI ,  最適パラメータ ,  ゲノム配列 ,  *DNA配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： sequence assembly ,  genome ,  flocculants bacteria ,  high-throughput sequencing ,  Paenibacillus

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： Paenibacillus ,  DNA配列 ,  組み込み ,  組立