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J-GLOBAL ID：201702240291231461   整理番号：17A0394374

ダイズ再生関連遺伝子遺伝子1のクローニングと発現解析【JST・京大機械翻訳】

Cloning and Expression Analysis of Regeneration Related Gene GmRUB1 in Soybean

著者 (7件)： Yu Yicheng (Key Laboratory of Soybean Biology in Chinese Ministry of Education, College of Agriculture, Northeast Agricultural University) ,  Pan Xiaocheng (Farm and Sideline Base of 65301 Army) ,  Xu Mengjie (Key Laboratory of Soybean Biology in Chinese Ministry of Education, College of Agriculture, Northeast Agricultural University) ,  Zhang Hechun (Key Laboratory of Soybean Biology in Chinese Ministry of Education, College of Agriculture, Northeast Agricultural University) ,  Wang Lingdong (Key Laboratory of Soybean Biology in Chinese Ministry of Education, College of Agriculture, Northeast Agricultural University) ,  Wei Yi (Key Laboratory of Soybean Biology in Chinese Ministry of Education, College of Agriculture, Northeast Agricultural University) ,  Wu Xiaoxia (Key Laboratory of Soybean Biology in Chinese Ministry of Education, College of Agriculture, Northeast Agricultural University)
資料名： Jiyinzuxue Yuyingyong Shengwu Xue  (Jiyinzuxue Yuyingyong Shengwu Xue)
巻： 35  号： 12  ページ： 3465-3473  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2933A  ISSN： 1674-568X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ダイズの再生過程は細胞の分裂と分化、器官の決定と形成にかかわる。RUB1遺伝子は物質の移動と蓄積及びユビキチン化過程などの多段階、多経路において重要な調節作用を発揮している。本研究では、実験室前期トランスクリプトームシークエンシング技術を用いて、差異発現遺伝子遺伝子1遺伝子を獲得することは、ダイズ再生中のユビキチン化過程の重要な構成部分である。PLACEデータベース,,,,データベース,SOPMA,,,PROTSCALE,MEGA5などのツールを用いて,この遺伝子のプロモーター,アミノ酸の機能,親水性,疎水性,等電点,二次構造,三次構造,相同性を比較した。ダイズ品種DONGNONG50の各器官におけるこの遺伝子の発現を分析した。結果により、その前駆体配列は再生に関与する多くの応答要素があり、理論的等電点は7.67、脂肪係数は79.34、安定係数は48.06、不安定タンパク質に属し、GMRUB1コード化タンパクはユビキチン結合タンパク質に属することが分かった。ユビキチン化過程におけるE2リガーゼのドメインがあり、二次構造中に24.59はΑ螺旋構造であり、39.34はランダムコイル、,はΒターン、%は拡張、三次構造は122個の水素結合、6個の螺旋構造を有する。18の回転角構造,親水性の平均係数は-0.389,GMRUB1遺伝子はアルファルファのものより近く,QRT-PCRの結果はGMRUB1の発現量が果実中で高く,GMRUB1遺伝子がダイズの再生過程に関与する可能性があることを示した。その後、この遺伝子に対してクローニング及び発現ベクターの構築を行った。これらの結果は,GMRUB1遺伝子コード化アミノ酸のバイオインフォマティクスと発現を予備的に分析した。それらのクローニングとベクター構築を通じて、今後この遺伝子の機能を研究し、ダイズの再生率を向上させ、安定したダイズ再生システムを確立するために理論的基礎を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ユビキチン ,  三次構造 ,  データベース ,  *遺伝子 ,  疎水性 ,  ユビキチン化 ,  ベクター ,  相同性 ,  プロモーター領域 ,  等電点 ,  ヘリックス構造 ,  アミノ酸 ,  *ダイズ
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  *クローニング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： GmRUBl ,  Cloning ,  Soybean ,  Regeneration ,  Bioinformatics

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  豆類  (FC03035U)

タイトルに関連する用語 (4件)： ダイズ ,  遺伝子 ,  クローニング ,  発現解析