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J-GLOBAL ID：201702240410638779   整理番号：17A0747213

合成低分子量調節RNAによるClostridium acetobutylicumにおける効率的な遺伝子ノックダウン【Powered by NICT】

Efficient gene knockdown in Clostridium acetobutylicum by synthetic small regulatory RNAs

著者 (4件)： Cho Changhee (Metabolic and Biomolecular Engineering National Research Laboratory, Department of Chemical and Biomolecular Engineering (BK21 Plus Program), Center for Systems and Synthetic Biotechnology, Institute for the BioCentury, KAIST, Daejeon, 34141, Republic of Korea) ,  Lee Sang Yup (Metabolic and Biomolecular Engineering National Research Laboratory, Department of Chemical and Biomolecular Engineering (BK21 Plus Program), Center for Systems and Synthetic Biotechnology, Institute for the BioCentury, KAIST, Daejeon, 34141, Republic of Korea) ,  Lee Sang Yup (BioProcess Engineering Research Center, KAIST, Daejeon, Republic of Korea) ,  Lee Sang Yup (BioInformatics Research Center, KAIST, Daejeon, Republic of Korea)
資料名： Biotechnology and Bioengineering  (Biotechnology and Bioengineering)
巻： 114  号： 2  ページ： 374-383  発行年： 2017年 
JST資料番号： D0019A  ISSN： 0006-3592  CODEN： BIBIAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Clostridiumは貴重な工業化学物質の生産のための有望な微生物宿主であると考えられている。しかし,Clostridiumは遺伝子操作の困難さで有名である,その結果代謝工学。,Clostridium株の遺伝的及び代謝工学のための新しいツールを開発するために作用している。ここでは,Clostridium acetobutylicumにおける制御された遺伝子発現,標的認識部位から成る,MicC RNA足場,RNAシャペロンHfqの合成低分子量調節RNA(sRNA)をベースにしたシステムの開発を報告した。C.acetobutylicumにおけるs RNAシステムの機能的動作を調べるために,発現制御は最初のモデル蛋白質としてEvoglow蛍光蛋白質を用いて調べた。Hfqとして注釈されたC.acetobutylicum蛋白質はEvoglow発現をノックダウンするためにEscherichia coli MicC足場に基づく合成sRNAと組み合わせた。しかし,C.acetobutylicum Hfqは大腸菌MicCに結合しなかったが,MicC足場ベースの合成sRNA自体はEvoglowの発現をノックダウンすることができた。E.coli hfq遺伝子を導入すると,蛍光強度を測定することにより評価したノックダウン効率を非常に増強することができた。,このE.coli MicC足場Hfqシステムは,C.acetobutylicumにおけるadhE1遺伝子発現をノックダウンするために使用した。合成RNAを用いたadhE1遺伝子発現のノックダウンは,ブタノール生産(2.5 g/L)が40%減少したが,空のベクターを持つ野生型株によって産生される(4.5 g/L)と比較した。sRNAシステムはさらに増強されたブタノール生産のためのbuk変異体C.acetobutylicum株PJC4BKのpta遺伝子発現をノックダウンするために拡張した。pta遺伝子発現ノックダウンを持つPJC4BK(pPta Hfq~エコ)株はブタノールの16.9g/L,であるPJC4BK株によって産生される(14.9 g/L)よりも高く,主に還元酢酸生産に起因して生成することができた。in situガスストリッピングと組み合わせたPJC4BK(pPta Hfq~エコ)株の流加培養は105.5g全溶媒(70.7gブタノール,20.5gアセトン,および14.3gエタノール)を産生し,sRNAベース工学C.acetobutylicum株は不安定性のない培養できることを実証した。本研究で報告した合成RNAシステムは,有益な化学物質および燃料を生産できる工学的C.acetobutylicum株のより効率的な開発に役立つであろう。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 遺伝子発現 ,  ベクター ,  遺伝子操作 ,  大腸菌 ,  *Clostridium ,  野生型 ,  *RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  タンパク質 ,  *遺伝 ,  *Clostridium acetobutylicum ,  脂肪酸 ,  薬物
準シソーラス用語： 低分子RNA ,  Hfq蛋白質 ,  代謝工学 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Clostridium acetobutylicum ,  合成sRNA ,  遺伝子発現制御 ,  遺伝子ノックダウン ,  ブタノール ,  Hfq

分類 (2件)： 微生物代謝産物の生産  (FK03020A) ,  代謝と栄養  (EG03054K)

物質索引 (1件)： 酢酸

タイトルに関連する用語 (5件)： 低分子量 ,  調節 ,  RNA ,  Clostridium ,  遺伝子ノックダウン