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J-GLOBAL ID：201702240955258542   整理番号：17A0475347

ヒトP5CR構造とその相互作用NADのR119G変異の影響:分子動力学シミュレーションと自由エネルギー解析から得られた知見【Powered by NICT】

Effect of the R119G mutation on human P5CR structure and its interactions with NAD: Insights derived from molecular dynamics simulation and free energy analysis

著者 (14件)： Sang Peng (Laboratory of Molecular Cardiology, Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, PR China) ,  Xie Yue-Hui (Department of Computer Science, The Faculty of Basic Medicine, Kunming Medical University, Kunming, PR China) ,  Li Lin-Hua (Laboratory of Molecular Cardiology, Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, PR China) ,  Ye Yu-Jia (Laboratory of Molecular Cardiology, Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, PR China) ,  Hu Wei (Laboratory of Molecular Cardiology, Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, PR China) ,  Wang Jing (Laboratory of Molecular Cardiology, Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, PR China) ,  Wan Wen (Laboratory of Molecular Cardiology, Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, PR China) ,  Li Rui (Laboratory of Molecular Cardiology, Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, PR China) ,  Li Long-Jun (Laboratory of Molecular Cardiology, Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, PR China) ,  Ma Lin-Ling (Laboratory of Molecular Cardiology, Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, PR China) ,  Li Zhi (Laboratory of Molecular Cardiology, Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, PR China) ,  Liu Shu-Qun (Laboratory of Molecular Cardiology, Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, PR China) ,  Liu Shu-Qun (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, Yunnan University, Kunming, PR China) ,  Meng Zhao-Hui (Laboratory of Molecular Cardiology, Department of Cardiology,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, PR China)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 67  ページ： 141-149  発行年： 2017年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 保存されたハウスキーピング役割を持つ酵素であるピロリン 5 カルボキシラートレダクターゼ(P5CR)は皮膚弛緩症の病因に関与している。の以前の研究は,P5CR蛋白質におけるR119G点突然変異が関与していることを示しているが,病理学の背後にある構造的機構は解明されていない。Cutis laxaにおけるR119G変異の役割を調べるために,著者らは野生型(WT)と変異体P5CR NAD複合体の自由エネルギー計算を結合する分子動力学(MD)シミュレーション,必須動力学(ED)分析,および分子力学Poisson-Boltzmann表面積(MM PBSA)を行った。これらMDシミュレーションとED分析はR119G変異はP5CRの柔軟性を減少させる,特に基質結合ポケット,補因子入口と出口の速度を減少させることができるのことを示唆した。さらに,MM-PBSA計算はR119G変異体はWTよりもNADの低い補因子結合親和性をもつことを示唆する。著者らの研究は,P5CRとNADとの相互作用中のR119G変異の可能な役割への洞察を提供し,変異は皮膚弛緩症を促進するかの理解をより優れた。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *自由エネルギー ,  補因子 ,  *分子動力学 ,  病因 ,  柔軟性 ,  野生型 ,  *変異 ,  基質 ,  分子内力学 ,  点突然変異 ,  結合部位 ,  *ヒト ,  表面積
準シソーラス用語： 結合親和性 ,  *分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： P5CR ,  皮膚弛緩症 ,  分子動力学 ,  自由結合エネルギー

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： ヒト ,  相互作用 ,  NAD ,  変異 ,  分子動力学シミュレーション ,  自由エネルギー ,  解析