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J-GLOBAL ID：201702245823651227   整理番号：17A0079240

雷蒙徳とアジアのTCP遺伝子ファミリーのバイオインフォマティクス解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Identification of the TCP Gene Family in Gossypium raimondii and Gossypium arboreum Using Bioinformatic Analysis

著者 (4件)： Li Yan (Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agriculture Sciences / State Key Laboratory of Cotton Biology) ,  Yao Jinbo (Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agriculture Sciences / State Key Laboratory of Cotton Biology) ,  Chen Wei (Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agriculture Sciences / State Key Laboratory of Cotton Biology) ,  Zhang Yongshan (Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agriculture Sciences / State Key Laboratory of Cotton Biology)
資料名： Mianhua Xuebao  (Mianhua Xuebao)
巻： 28  号： 5  ページ： 434-442  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2409A  ISSN： 1002-7807  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： TCP遺伝子ファミリーは植物に特有の転写因子ファミリーであり、植物の多種の成長経路及び各種生理生化学的反応のシグナル伝達に関与している。TCP ととと TCPにおけるTCP遺伝子ファミリーの数と分布をより良く理解するために,37のTCP遺伝子ファミリーメンバーを,生物(D5)とアジア(A2)のゲノムにおいて,バイオインフォマティクスによって同定した。また、TCPファミリーメンバーに対して遺伝子構造、染色体定位、ドメイン、進化関係などの分析を行った。結果は,37のTCP転写因子メンバーが,雷蒙徳と氏棉遺伝子によってコード化されることを示した。雷蒙徳の30のメンバーは10の染色体に分布し,37の遺伝子は13の染色体に分布した。イントロン/エキソン構造解析により、TCP遺伝子構造は比較的に簡単であり、大部分はイントロンを含まないことが分かった。機能ドメイン分析により、すべてのTCP転写因子は高度に保存されたTCPドメインを有することが分かった。ドメイン構造の違いと系統発生分析の結果に基づき、TCP遺伝子ファミリーを2つの亜族に分け、更にPCF、CIN、CYC/TBの亜群に分けた。以上の結果は、綿花のTCP遺伝子ファミリーの各メンバーの機能をさらに研究するために、一定の理論的基礎を築いた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： イントロン ,  化学反応 ,  定位 ,  構造解析 ,  ゲノム ,  *遺伝子 ,  符号化 ,  転写因子 ,  染色体 ,  *アジア
準シソーラス用語： 系統解析 ,  ドメイン構造 ,  遺伝子構造 ,  *バイオインフォマティクス ,  *遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： TCP gene family ,  Gossypium raimondii ,  Gossypium arboreum ,  bioinformatics

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： 雷 ,  徳 ,  アジア ,  TCP ,  遺伝子ファミリー ,  バイオインフォマティクス解析