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J-GLOBAL ID：201702249833992159   整理番号：17A0478465

Pathway Inspector モデル生物および非モデル生物のRNAseq解析のための経路ベースのウェブアプリケーション

Pathway Inspector: a pathway based web application for RNAseq analysis of model and non-model organisms

著者 (8件)： BIANCO Luca (Edmund Mach Foundation, Michele all’Adige, ITA) ,  RICCADONNA Samantha (Edmund Mach Foundation, Michele all’Adige, ITA) ,  LAVEZZO Enrico (Univ. Padova, Padova, ITA) ,  FALDA Marco (Univ. Padova, Padova, ITA) ,  FORMENTIN Elide (Univ. Padova, Padova, ITA) ,  CAVALIERI Duccio (Edmund Mach Foundation, Michele all’Adige, ITA) ,  TOPPO Stefano (Univ. Padova, Padova, ITA) ,  FONTANA Paolo (Edmund Mach Foundation, Michele all’Adige, ITA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 3  ページ： 453-455  発行年： 2017年02月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 複雑なRNAseq実験における発現パターンの発見のためのウェブアプリケーションPathway Inspectorについて示した。Pathway Inspectorは,発現解析を遺伝子レベルで実行するモジュールおよび経路レベルで実行するモジュールから構成された。Pathway Inspectorにより,モデル生物および非モデル生物において変化した経路を容易に発見することが可能で,KEGGウェブサービスを用いて遺伝子のアノテーションを行うことができた。Pathway Inspectorはウェブサイトから入手可能である。

シソーラス用語： 応用プログラム ,  生体モデル ,  遺伝学実験技術 ,  *遺伝子発現 ,  遺伝子 ,  モジュール ,  データベース ,  *アノテーション
準シソーラス用語： KEGG ,  *Pathway Inspector ,  *RNA-seq ,  RNA配列解析 ,  ウェブアプリケーション ,  遺伝子発現パターン ,  *遺伝子発現解析 ,  生物モデル

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： モデル ,  生物 ,  解析 ,  経路 ,  ウェブアプリケーション