Rhodnius prolixus(オオサシガメ)の配列決定されたゲノムにおけるmariner様要素の転位バースト【Powered by NICT】

Fernandez-Medina R.D.; Granzotto A.; Ribeiro J.M.; Carareto C.M.A.

文献

J-GLOBAL ID：201702251563204222 整理番号：17A0309729

Rhodnius prolixus(オオサシガメ)の配列決定されたゲノムにおけるmariner様要素の転位バースト【Powered by NICT】

Transposition burst of mariner-like elements in the sequenced genome of Rhodnius prolixus

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資料名：
巻： 69 ページ： 14-24 発行年： 2016年02月
JST資料番号： D0873A ISSN： 0965-1748 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

転移性遺伝要素(TEs)は昆虫のゲノムに広く分布している。しかし,異なる種におけるこれらの反復配列が占める全DNA含量の割合に広い違いがある。R.prolixus(シャーガス病のベクター)に存在するTEを分析し,本ゲノムの3.0%はクラスII TEにより占有されることを示し,主にTc1marinerスーパーファミリー(1.65%)とMITE(1.84%)に属する。興味深いことに,このゲノム内容のほとんどはに属する二サブファミリーの拡大によるirritans himar,船員の良く特性化されたサブファミリー,prolixus1,ここで記述した二種類の新規なサブファミリーの一つである。これらのサブファミリー中の配列の高量は転位のバーストは,このファミリーのライフサイクル中に発生したことを示唆した。これらの元素を特性化する試みでは,トランスポザーゼ遺伝子のDDD/Eドメインに対応する配列のin silico解析を行った。増幅の動力学を推定するために,これらのサブファミリーで同定されたバーストの時間を推定するために,ネットワークとBayesian coalescentベース法を含む進化的解析を行った。データが与えられたとき,TE展開は約1.4mya R.prolixusのスペシエーションの頃起きたと仮定した。この示唆はTE進化の「トランスポゾンモデル」である複製活性であることがTE個体群のメンバーはゲノムにおける複数の遺伝子座に存在するが,その複製能が変化する,現在のTEは,増幅バーストに関与しているとき,それらはこの初期増幅に遡ることを先祖コピーを共有していることを述べている「ライフサイクルモデル」のある。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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動物の生化学

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