文献

J-GLOBAL ID：201702252696761548   整理番号：17A0353098

緑色藻類杜氏(カロチノイド)の遺伝子バイオインフォマティクスと転写差異研究【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analysis and transcription difference of carotenoid isomerase (CRTISO) gene in Dunaliella viridis

著者 (4件)： Zhou Liya (School of Marines Science,Ningbo University) ,  Gong Yifu (School of Marines Science,Ningbo University) ,  Zhu Shuaiqi (School of Marines Science,Ningbo University) ,  Wang Heyu (School of Marines Science,Ningbo University)
資料名： Shengwu Xue Zazhi  (Shengwu Xue Zazhi)
巻： 33  号： 6  ページ： 15-19  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2987A  ISSN： 2095-1736  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： カロチノイド(イソメラーゼ ISOMERASE,CRTISO)はカロチノイド生合成経路においてリコピンがシス構造からトランス構造へ転換する鍵酵素である。トランスクリプトーム CDNA CDNAの完全長CDNA配列をトランスクリプトーム配列決定によって得て,生物(ASA)とアラキドン酸(AA)によって処理した緑色の杜氏の遺伝子転写とカロチノイド含有量の変化を研究した。バイオインフォマティクスの結果は以下を示した。グリーン CDNAは全長BPのオープンリーディングフレーム(ORF)を含み,264アミノ酸残基をコードする795BPのオープンリーディングフレーム(ORF)を含んでいた。このタンパク質の理論的相対分子量は29 522.6であり、理論的等電点(PI)は5.86であり、このタンパクは安定タンパク質と親水性タンパク質であり、シグナルペプチドと膜貫通領域がなく、細胞質基質に定位している。アミノ酸配列の相同性比較の結果は,それらが最も高い相同性(78%)を持つことを示した。RT-QPCRの結果,AA,ASAの誘導後,遺伝子発現は最初増加し,次に減少し,AA,ASAの濃度が62.5MG/L,50MG/Lのときに最も高い発現を示した。カロチノイド含有量は,徐々に増加した。AAとASAの濃度がそれぞれ312.5MG/Lと100MG/Lのとき,カロチノイドの含有量は最も高かった。これらの遺伝子は,カロチノイド含有量と相関していた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アミノ酸残基 ,  親水性 ,  トランスクリプトーム ,  基質 ,  タンパク質 ,  シグナルペプチド ,  *カロチノイド ,  アミノ酸配列 ,  分子量 ,  *遺伝子 ,  相同性 ,  等電点
準シソーラス用語： 膜貫通領域 ,  オープンリーディングフレーム ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Dunaliella viridis ,  carotenoid isomerase ,  bioinformatic ,  carotenoid

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (8件)： 緑色 ,  藻類 ,  カロチノイド ,  遺伝子 ,  バイオインフォマティクス ,  転写 ,  差異 ,  研究