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J-GLOBAL ID：201702254692930290   整理番号：17A0529538

コンブのトランスクリプトーム配列の特徴とその関連遺伝子の機能の分析を行った。【JST・京大機械翻訳】

Characterization of SSR in Saccharina japonica transcriptome and functional analysis of SSR-containing unigenes

著者 (5件)： Li Qiuying (Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology) ,  Zhang Jie (Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology) ,  Yao Jianting (Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology) ,  Wang Xiuliang (Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology) ,  Duan Delin (Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology)
資料名： Haiyang Kexue  (Haiyang Kexue)
巻： 40  号： 11  ページ： 1-6  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2025A  ISSN： 1000-3096  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： コンブ JAPONICAのトランスクリプトーム配列データを分析し,70の単純配列反復(SSR)遺伝子座を70のUNIGENESから検出した。また,SSR配列を含むUNIGENESに対して機能アノテーションを行う.コンブの中のSSRのタイプは非常に豊富で、その中にモノヌクレオチドとトリヌクレオチドの反復SSRの数量は最も多く、それぞれSSRの総数の40.9%と39.4%を占め、その次は4、ジヌクレオチド、5と6.1%,3.1%と0.7%であった。SSR反復ユニットは147種類であり,その反復回数の範囲は5~70回であった。機能アノテーションは,約50%のSSRを含むUNIGENESがアノテーション情報を得ており,多くの既知の蛋白質と相同性があることを示した。COGとGOの機能分類の結果により、多数のSSR配列を含む遺伝子は多くの生物機能と関係があり、そのうち、炭水化物代謝及び細胞構成に関与する遺伝子の数量が最も多いことが明らかになった。本研究の結果は,機能性SSRマーカーの更なる開発のための基礎を提供し,コンブの分子マーカー支援選抜育種のための支援を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アノテーション ,  相同性 ,  *コンブ ,  分離育種 ,  糖質代謝 ,  *トランスクリプトーム ,  ジヌクレオチド ,  *遺伝子 ,  タンパク質
準シソーラス用語： 分子マーカー ,  マイクロサテライトマーカー ,  機能性 ,  トリヌクレオチド , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： microsatellite ,  transcriptome ,  simple sequence repeat (SSR) ,  Saccharina japonica

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  トウモロコシ  (FC03034D) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (4件)： コンブ ,  トランスクリプトーム ,  遺伝子 ,  分析