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J-GLOBAL ID：201702255051429311   整理番号：17A0536921

アブラナ種(B. NAPUS, B. RAPA, B. OLERACEA) TCP遺伝子ファミリーの全ゲノム同定と分析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide Identification and Analysis of TCP Gene Family in Brassica species (B. napus, B. rapa, B. oleracea)

著者 (2件)： Lu Qifeng (Guangxi Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Guangxi Key Laboratory of Plant Conservation and Restoration Ecology in Karst Terrain) ,  Huang Zhihuan (Guangxi Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Guangxi Key Laboratory of Plant Conservation and Restoration Ecology in Karst Terrain)
資料名： Fenzi Zhiwu Yuzhong  (Fenzi Zhiwu Yuzhong)
巻： 14  号： 12  ページ： 3289-3298  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2681A  ISSN： 1672-416X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： TCPタンパクは植物特有の転写因子であり、植物の葉の発育、花の対称性、側枝の発育などの過程に広く参与し、重要な調節作用がある。 属のTCP遺伝子ファミリーの機能と進化関係を明らかにするため、本研究では、生物情報学方法を利用して白菜、キャベツとBRASSICA NAPUSのTCP転写因子ファミリーのメンバー、遺伝子分類、遺伝子構造、系統研究により、白菜とキャベツのTCP遺伝子のメンバーはそれぞれ37本、BRASSICA NAPUSのTCP遺伝子のメンバーは78本であり、しかもすべて親水性タンパクであり、大部分のTCP遺伝子の構造は簡単で、イントロンを含まない配列解析は,これらのTCP遺伝子が高度に保存されたTCPドメインを持つことを示した。地域差と系統発生分析の結果に基づき、白菜、キャベツ、BRASSICA NAPUS TCP遺伝子を2種類に分けた。CLASS IとCLASSの領域において、CLASS領域はCINとCYC/TB1の二つのグループに分けることができる。クラスタ分析の結果,ハクサイ,キャベツ,BRASSICA NAPUSのTCP遺伝子はARABIDOPSIS THALIANAにおける垂直11,,16,ATTCP23のTCP遺伝子の欠失と関連しており,アブラナの発生や順化の過程での人工以上の研究は 属のTCP遺伝子の機能を明らかにするために重要な理論的基礎を提供する。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 転写因子 ,  順応 ,  地域差 ,  ハクサイ ,  *ゲノム ,  キャベツ ,  タンパク質 ,  イントロン ,  *アブラナ ,  クラスタ分析 ,  *遺伝子
準シソーラス用語： 系統解析 ,  遺伝子構造 ,  バイオインフォマティクス ,  *遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Brassica ,  TCP gene family ,  Genome-wide identification ,  Conserved structure domains ,  Phylogenetic analysis

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： アブラナ ,  TCP ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  分析