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J-GLOBAL ID：201702256017963440   整理番号：17A0203946

BRASSICA NAPUS BNMYB80遺伝子のバイオインフォマティクス解析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics Analysis of BnMYB80 Genes in Brassica napus

著者 (6件)： Jia Ledong (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University) ,  Li Shimeng (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University) ,  Xu Daixiang (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University) ,  Qu Cunmin (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University) ,  Li Jiana (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University) ,  Wang Rui (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University)
資料名： Zhiwu Xuebao  (Zhiwu Xuebao)
巻： 51  号： 5  ページ： 620-630  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2141B  ISSN： 1674-3466  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 高等植物の葯の発育と花粉の形成において、MYB転写因子は非常に重要な役割を果たしており、その中のMYB80はタペートの発育と雄性不稔を引き起こす重要な転写因子である。本研究では,ARABIDOPSIS THALIANA ATMYB80を参照配列とし,BLASTにより分析した。ハクサイ(BRASSICA RAPA),キャベツ(B. OLERACEA)およびキャベツ(BRASSICA NAPUS)におけるMYB80遺伝子の2,2および6つの相同配列を得た。バイオインフォマティクス法を用いて,ヌクレオチド配列とコード化アミノ酸配列を,構成要素,亜細胞局在化,リン酸化部位,疎水性/親水性,蛋白質二次,三次構造,および機能ドメインによって分析した。結果により、MYB80転写因子の細胞は核に位置し、複数の異なるリン酸化部位を持ち、ペプチド鎖は親水性を示した。二次および三次構造予測により,MYB80蛋白質は,Α-ヘリックスおよびランダムコイルによって構成されることが分かった。保存ドメインの分析により、そのN末端に2つの直列のSANT機能ドメインがあり、R2R3型MYB転写因子に属することが分かった。多重配列アラインメントと系統樹解析の結果は,BRASSICA NAPUSとBRASSICA OLERACEAの間の配列類似性が92%以上であり,MYB80転写因子の機能ドメインが高い相同性と強い保存性を持つことを示した。本研究の結果は,BRASSICA NAPUS L.80の生物学的機能および稔性調節の分子機構を解析する上で重要な役割を果たし,BRASSICA NAPUSの雑種強勢の利用のための基礎を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 三次構造 ,  *転写因子 ,  疎水性 ,  キャベツ ,  アミノ酸配列 ,  雄性不稔 ,  類似性 ,  親水性 ,  相同性 ,  ヌクレオチド配列 ,  花粉
準シソーラス用語： 系統解析 ,  リン酸化部位 ,  BLAST ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： bioinformatics ,  Brassica napus ,  MYB80 ,  pollen development ,  tapetum

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生殖  (EH02040F)

タイトルに関連する用語 (3件)： Brassica ,  遺伝子 ,  バイオインフォマティクス解析