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J-GLOBAL ID：201702256354479854   整理番号：17A0350542

HAPMAPデータベースを用いて,HBG1-HBD遺伝子間のハプロタイプとSNPの選択を分析した。【JST・京大機械翻訳】

Haplotypes and tagSNPs selected in the HBG1-HBD intergenic region: Analysis based on the Hapmap database

著者 (7件)： Han Wenping (Department of Laboratory, Affiliated People’s Hospital of Guizhou Medical University) ,  Huang Shengwen (Department of Laboratory, Affiliated People’s Hospital of Guizhou Medical University) ,  Huang Ling (机構不詳) ,  Wang Siying (Department of Laboratory, Affiliated People’s Hospital of Guizhou Medical University) ,  Han Yuanyuan (Department of Laboratory, Affiliated People’s Hospital of Guizhou Medical University) ,  Wang Yuchuan (Department of Pediatrics, Affiliated People’s Hospital of Guizhou Medical University) ,  An Bangquan (Department of Laboratory, Affiliated People’s Hospital of Guizhou Medical University)
資料名： Yixue Yanjiusheng Xuebao  (Yixue Yanjiusheng Xuebao)
巻： 29  号： 12  ページ： 1281-1285  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3037A  ISSN： 1008-8199  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： HBG1-HBD遺伝子の配列はΓグロビン遺伝子の発現に重要な役割を果たし、中国の北京漢民族のHBG1-HBD遺伝子間の配列のハプロタイプを分析し、ラベルSNP(TAGSNP)を選別する。【方法】HAPMAPデータベースからに1-HBD遺伝子の間の中国の漢民族のすべてのSNPデータをダウンロードした。HBG 4.0ソフトウェアを用いてHBG1-HBD遺伝子間のSNPの連鎖不平衡分析を行い、これに基づき、HBG1-HBD遺伝子間の配列範囲の単倍域とハプロタイプを構築した。MEGAソフトウェアを用いてハプロタイプをクラスター分析し,SNPの間のR2値によって異なるハプロタイプを代表するTAGSNPを選抜した。結果:中国の北京漢民族において、HBG1-HBD遺伝子間に2つの単倍域(BLOCK1とBLOCK2)があり、それぞれ7種類と3種類のハプロタイプがあり、発生頻度はいずれも1%以上であった。クラスター分析により、BLOCK1のハプロタイプを2つのグループに分け、相互に代表する11のTAGSNPを通じてグループ分けを行うことができ、11のSNPは順次次の通りである。RS3813727,RS10837643,RS4320977,RS4283007,RS4402323,RS4910543,RS4910736,RS2105819,RS968857,RS968856,RS10768687。結論:中国の北京漢民族におけるHBG1-HBD遺伝子間のハプロタイプととは,HBG1-HBD遺伝子間のハプロタイプとΓグロビン遺伝子発現の間の相関を研究するための基礎を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子発現 ,  クラスタ分析 ,  *ハプロタイプ ,  ソフトウェア ,  *データベース ,  グロビン ,  中華人民共和国 ,  *遺伝子
準シソーラス用語： 発生頻度 ,  連鎖不平衡 ,  漢民族 ,  北京市 ,  グロビン遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Hapmap ,  HBG1-HBD intergenic region ,  TagSNP ,  Haplotype

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： データベース ,  ハプロタイプ ,  SNP ,  分析