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J-GLOBAL ID：201702258019347226   整理番号：17A0159573

RNAのハイスループット配列分析に基づき、灰色ブドウ球菌の形成に関連する遺伝子を分析した。【JST・京大機械翻訳】

High-throughput RNA sequencing-based analysis of differentially expressed genes associated with infection cushion formation in Botrytis cinerea

著者 (6件)： Zhang Jing (Huazhong Agricultural University State Key Laboratory of Agricultural Microbiology) ,  Tang Jiejing (Huazhong Agricultural University State Key Laboratory of Agricultural Microbiology) ,  Zhang Lei (Institute of Plant Protection,Sichuan Academy of Agricultural Sciences) ,  Wu Mingde (Huazhong Agricultural University State Key Laboratory of Agricultural Microbiology) ,  Yang Long (Huazhong Agricultural University State Key Laboratory of Agricultural Microbiology) ,  Li Guoqing (Huazhong Agricultural University State Key Laboratory of Agricultural Microbiology)
資料名： Zhiwu Bingli Xuebao  (Zhiwu Bingli Xuebao)
巻： 46  号： 5  ページ： 605-613  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2145A  ISSN： 0412-0914  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 灰は機能的に付着した細胞のような宿主に寄生する宿主植物を産生するが,侵染Dianの形成に対する分子機構は不明である。本研究では,ハイスループット配列決定法を用いて,菌株CANBC-1(弱毒化,非形成性)およびと-1C-66(強毒性,正常形成形成)の転写レベルを比較した。結果は以下を示す。2つの遺伝子発現株(株-1C-66)を,株-1において検出し,それらの間で,1の遺伝子発現は上方制御され,そして,908の遺伝子発現は下方制御された。差次的発現遺伝子の機能的アノテーション(GO)分析により、細胞成分(CELLULAR COMPONENT)において、細胞(CELL)と細胞部分(CELL PART)の2つの亜群が占める割合が大きいことが分かった。分子機能(MOLECULAR FUNCTION)では結合活性(BINDING)と触媒活性( )の2つのサブクラスが占める割合が大きい。これらの結果は,差異遺伝子が主に細胞,代謝および発育などの生物学的過程に関与していることを示唆している。12個の真菌に関連する遺伝子をスクリーニングし、そのうちBC1G_03994とBC1G_01012はいもち病菌に関連するCLASS II疎水性タンパク質遺伝子MHP1と同源であることが分かった。RT-PCRの結果は,2つの遺伝子が接種-1において下方制御され,それらの疎水性が減少し,それが の形成に関与している可能性があることを示した。これらの差異遺伝子の獲得は,灰の分子機構の解明のための基礎を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 触媒活性 ,  遺伝子発現 ,  *遺伝子 ,  疎水性 ,  アノテーション ,  アップレギュレーション ,  ダウンレギュレーション ,  RT-PCR法 ,  イネいもち病菌
準シソーラス用語： 差次的遺伝子発現 ,  弱毒化 ,  菌株 ,  分子機構 ,  *配列解析 ,  *ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Botrytis cinerea ,  infection cushion ,  differential expression profile analysis ,  differentially expressed genes

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： RNA ,  ハイスループット ,  配列分析 ,  灰色 ,  ブドウ球菌 ,  遺伝子 ,  分析