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J-GLOBAL ID:201702258613359231   整理番号:17A0398607

1例としての植物,Peucedani Radixの定量的メタボロームプロファイリングのための統合作業フロー【Powered by NICT】

Integrated work-flow for quantitative metabolome profiling of plants, Peucedani Radix as a case
著者 (10件):
資料名:
巻: 953  ページ: 40-47  発行年: 2017年 
JST資料番号: A0394A  ISSN: 0003-2670  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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複雑なマトリックスの定性的および定量的特性に関する信頼できる情報の普遍的獲得はメタボロミクス研究の成功のための前提である。液体クロマトグラフィー-質量分析(LC MS)はメタボロミクスのための主力であるが,LC-MS非標的メタボロミクスは,いくつかの欠点に悩まされている,いくつかの最先端技術が導入されている。ここで,ある程度,取り組む通常の方法の欠点,冗長な情報,検出器飽和,低感度,異なる試験間の一定でない信号数のような,を目指して,三進行性段階の新規で柔軟なワークフローを植物の定量的メタボロームをプロファイルするため提案した。種々のクマリン異性体に富んだPeucedanum praeruptorum Dunn(Peucedani Radix,PR)の根は,適用性を検証するための事例研究として使用した。最初に,オフライン二次元LC-MSは,プールされたPR抽出物中の代謝産物の徹底的な検出すなわち普遍的なメタボローム標準(UMS)に利用した。第二に,質量フラグメンテーション規則,特にPRにおける一次化学相同体であることを角型ピラノクマリンに関する,利用可能なデータベースはシグナル帰属および構造アノテーションのための統合した。第三に,最適衝突エネルギー(OCE)や多重モニタリング反応測定のためのイオン遷移は各注釈付き成分のための参照化合物フリー戦略を用いたオンライン最適化し,アノテートされた全成分の大規模相対的定量は,UMSを希釈連続による検量線をプロットすることにより達成した。異性体識別のためのOCEの可能性を記述し,これらの一次成分の直線性範囲は,それらの応答を抑制することにより拡張したことに注目する価値がある。だけでなく定性的情報を提供する全体的でなく,正確な定量的データセットを直接的に可能性があるため,統合ワークフローは,植物の定量的メタボロームを明らかにする有望なパイプラインとして適格であると期待されている。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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