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J-GLOBAL ID：201702259170645939   整理番号：17A0109472

ブラックベリーRUTT12-1遺伝子コドンバイアス解析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of Codon Usage Bias of RuTT12-1 Gene in Blackberry

著者 (4件)： Feng Chen (College of Horticulture, Sichuan Agricultural University) ,  Zhang Yunting (College of Horticulture, Sichuan Agricultural University) ,  Xiao Jie (College of Horticulture, Sichuan Agricultural University) ,  Tang Haoru (College of Horticulture, Sichuan Agricultural University)
資料名： Jiyinzuxue Yuyingyong Shengwu Xue  (Jiyinzuxue Yuyingyong Shengwu Xue)
巻： 35  号： 8  ページ： 2133-2144  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2933A  ISSN： 1674-568X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： MATEファミリー(MULTIDRUG AND TOXIN EFFLUX)メンバーTT12(TRANSPARENT TESTA12)は植物に広く存在している。これらの結果は,植物のアントシアニンとプロアントシアニジンが細胞壁から中央液胞までの重要な輸送体であることを示した。ベリー(SPP. SPP.)のTT12遺伝子(RUTT12-1)の配列を,CUSPととオンラインプログラムによって分析し,そして,遺伝子のコドン利用特性を,モデル植物ゲノムと他の植物のTT12遺伝子と比較した。そして,それらの特性に従って,適切な発現システムを選択することは,重要な意味を持つ。結果により、遺伝子発現量は高くなく、A/Tで終わるコドンを選択し、しかも7種類の最適コドンもすべてA/Tで終わることが分かった。コドンの使用頻度は,以下の通りであった。RUTT12-1遺伝子とシロイヌナズナ(ARABIDOPSIS THALIANA)、タバコ(NICOTIANA TOBACUML.)の差異はトウモロコシ(ZEA MAYS)、小麦(TRITICUM AESTIVUM)の差異より小さかった。そのためシロイヌナズナとタバコはこの遺伝子の異種発現宿主としてより適している。35種の植物TT12遺伝子コドン選好係数と比較することにより,大部分のTT12遺伝子は,A/Tによるコドンを使用し,その機能に関連している可能性があることが示唆された。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細胞壁 ,  *コドン ,  液胞 ,  アントシアニン ,  たばこ ,  *遺伝子 ,  コムギ ,  異種発現 ,  植物ゲノム ,  *ベリー類 ,  *コドンバイアス ,  *ブラックベリー ,  シロイヌナズナ ,  膜 ,  生体膜 ,  芳香族縮合化合物
準シソーラス用語： Arabidopsis thaliana ,  輸送体 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Blackberry (Rubus spp.) ,  RuTT12-1 gene ,  Codon bias

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： プロアントシアニジン

タイトルに関連する用語 (4件)： ブラックベリー ,  遺伝子 ,  コドンバイアス ,  解析