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J-GLOBAL ID：201702260909649159   整理番号：17A0702194

多くの配列に基づいた特徴の混淆化による蛋白質リジンphosphoglycerylation部位の予測【Powered by NICT】

Predicting protein lysine phosphoglycerylation sites by hybridizing many sequence based features

著者 (3件)： Chen Qing-Yun (School of Computer Science and Technology, Tianjin University, Tianjin 300350, China. [e-mail]) ,  Tang Jijun ,  Du Pu-Feng
資料名： Molecular BioSystems  (Molecular BioSystems)
巻： 13  号： 5  ページ： 874-882  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2331A  ISSN： 1742-206X  CODEN： MBOIBW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 翻訳後修飾(PTM)は多くの生物学的過程に必須である。蛋白質の共有結合および一般的に酵素的修飾は蛋白質の活性に影響を与えることができる。修飾蛋白質は,より複雑な構造と機能を持つであろう。特異的残基は修飾されるかどうかを知ることは,この蛋白質の機能と構造を解明するために重要である。蛋白質PTM部位は常に高価で時間がかかるを発見するための実験的アプローチとして,計算予測法が望まれている代替法。リジンphosphoglycerylationである解糖過程とグルコース代謝に関係していることを新たに発見されたPTMの一種である。リジンphosphoglycerylationプロセスは触媒酵素を必要としないので,そのサイト選択性機構はまだ十分解明されていない。本研究では,リジンphosphoglycerylation部位を同定するために,すなわちPhoglyPred,新しい計算方法を設計した。いくつかの異なる蛋白質配列記述子を利用して,PhoglyPredはジャックナイフ試験,他の最先端の予測因子よりも良好な90.3%の全体的な精度を達成した。Fスコアを用いた異なる特徴の重要性を解析することによって,著者らは,いくつかの重要な配列特徴,リジンphosphoglycerylationのサイト選択性機構を理解する上で将来の研究に役立つ可能性を見出した。Copyright 2017 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 予測技法 ,  酵素 ,  共有結合 ,  解糖 ,  *タンパク質 ,  敷地選定 ,  翻訳後修飾 ,  触媒
準シソーラス用語： スコア ,  予測因子 ,  最先端 ,  グルコース代謝 ,  残基 ,  酵素的修飾 ,  生物学的過程 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： 蛋白質 ,  リジン ,  予測