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J-GLOBAL ID：201702261245637427   整理番号：17A0219349

ab initio量子力学/分子力学の分子動力学シミュレーションのための環境-ポテンシャル複合Ewald法

Ambient-Potential Composite Ewald Method for ab Initio Quantum Mechanical/Molecular Mechanical Molecular Dynamics Simulation

著者 (2件)： GIESE Timothy J. (Rutgers Univ., New Jersey, USA) ,  YORK Darrin M. (Rutgers Univ., New Jersey, USA)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 12  号： 6  ページ： 2611-2632  発行年： 2016年06月 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 拡張原子軌道(AO)基底セットを使ったas initio量子力学/分子力学(QM/MM)シミュレーションにおいて粒子メッシュEwaldを遂行するための新たなアプローチを提示した。本アプローチである環境-ポテンシャル複合Ewald法では,Mulliken電荷,又は静電的適合電荷とのQM/MM相互作用の代わりに,原子核と電子密度がMM環境と,密なフーリエ変換グリッドを使わずに,直接相互作用する。りん酸p-ニトロフェニルの分解反応の平均力ポテンシャル(PMF)プロファルを計算するためにアンブレラウインドウシミュレーションを行い,この新たなEwald法をいくつかの他の静電プロトコルと比較した。非経験的な反応障壁は半経験的モデルよりも,実験とより良く一致した。

シソーラス用語： 計算機シミュレーション ,  *数値解法 ,  動径分布関数 ,  分解反応 ,  ポテンシャル障壁 ,  *分子内力学 ,  計算化学 ,  分子軌道 ,  ab initio法 ,  電位
準シソーラス用語： *分子動力学シミュレーション ,  *Ewald法 ,  反応障壁 ,  *量子力学/分子力学法 ,  静電ポテンシャル

分類 (1件)： 分子の電子構造  (BH05010Q)

物質索引 (1件)： りん酸p-ニトロフェニル

タイトルに関連する用語 (6件)： 量子力学 ,  分子力学 ,  分子動力学シミュレーション ,  環境 ,  ポテンシャル ,  Ewald法