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J-GLOBAL ID：201702263314408952   整理番号：17A0412230

遺伝子-遺伝子相互作用を検出するための新しいファジィ集合に基づく多因子次元縮小法【Powered by NICT】

A novel fuzzy set based multifactor dimensionality reduction method for detecting gene-gene interaction

著者 (5件)： Jung Hye-Young (Faculty of Liberal Education, Seoul National University, Seoul, 08826, South Korea) ,  Leem Sangseob (Department of Statistics, Seoul National University, Seoul, 08826, South Korea) ,  Lee Sungyoung (Interdisciplinary Program of Bioinformatics, Seoul National University, Seoul, 08826, South Korea) ,  Park Taesung (Department of Statistics, Seoul National University, Seoul, 08826, South Korea) ,  Park Taesung (Interdisciplinary Program of Bioinformatics, Seoul National University, Seoul, 08826, South Korea)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 65  ページ： 193-202  発行年： 2016年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子-遺伝子相互作用(GGI)は遺伝的関連研究における一般的な複雑な形質の失われた遺伝率を見つけるための最も一般的な方法の一つである。多因子次元縮小(MDR)法はGGIsを検出するための広く研究されている。疾患感受性と関連して,最良の相互作用モデルを同定するために,MDRは単純な二成分高(H)と低(L)リスク分類から疾患状態の予測可能性の点ですべての可能な遺伝子型の組合せを比較した。しかし,この単純な二値分類はH/L分類の不確実性を反映していない。二リスクグループのメンバシップの程度を定義するH/Lと同等にH/Lを分類する。ファジィ集合理論を採用することにより,著者らはH/L分類の不確実性を考慮に入れたファジィMDRを提案した。ファジィMDRは不確実性の度合いを形質転換する[0,1]スケールにメンバシップ関数によるH/Lの部分的メンバシップの可能性を可能にした。最良遺伝子型の組み合わせは,新しいファジィ集合に基づく精度測度を最大化する選択できる。二シミュレーション研究はMDRのそれと提案したファジィMDRの能力を比較するために実施した。著者らの結果は,ファジィMDRはMDRより高い出力を持つことを示した。BDに関連したGGIを検出するために,WTCCCデータセットの双極性障害(BD)特性を解析することにより,提案したファジィMDRを説明した。H/L分類の不確実性を考慮に入れて遺伝子-遺伝子相互作用を検出するための新しいファジィMDR法を提案し,それがMDRより高い出力を持つことを示した。ファジィMDRは連続表現型を同様に扱うに容易に拡張できる。提案したファジィMDRに対するRで書かれたプログラムであるhttps://statgen.snu.ac.kr/software/FuzzyMDRで利用可能である。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 遺伝率 ,  メンバシップ関数 ,  *ファジィ集合 ,  表現型 ,  不確実性 ,  *次元縮小 ,  測度 ,  予測可能性 ,  *遺伝子 ,  *曖昧さ ,  遺伝子型 ,  *相互作用 ,  双極性障害
準シソーラス用語： 躁うつ病 ,  遺伝的関連研究 ,  *遺伝子相互作用 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 遺伝子-遺伝子相互作用 ,  多因子次元縮小 ,  ファジィ分類器 ,  ファジィ集合理論 ,  不確実性

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (3件)： 遺伝子-遺伝子相互作用 ,  ファジィ集合 ,  多因子次元縮小法